Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ89

March6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March6Q6ZQ89 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
March6Q6ZQ89 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
March6Q6ZQ89 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
March6Q6ZQ89 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
March6Q6ZQ89 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
March6Q6ZQ89 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
March6Q6ZQ89 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
March6Q6ZQ89 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
March6Q6ZQ89 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
March6Q6ZQ89 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
March6Q6ZQ89 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
March6Q6ZQ89 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
March6Q6ZQ89 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
March6Q6ZQ89 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
March6Q6ZQ89 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
March6Q6ZQ89 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
March6Q6ZQ89 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
March6Q6ZQ89 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
March6Q6ZQ89 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
March6Q6ZQ89 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
March6Q6ZQ89 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
March6Q6ZQ89 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
March6Q6ZQ89 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
March6Q6ZQ89 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
March6Q6ZQ89 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
March6Q6ZQ89 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
March6Q6ZQ89 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
March6Q6ZQ89 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
March6Q6ZQ89 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
March6Q6ZQ89 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
March6Q6ZQ89 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
March6Q6ZQ89 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
March6Q6ZQ89 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
March6Q6ZQ89 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
March6Q6ZQ89 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
March6Q6ZQ89 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
March6Q6ZQ89 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
March6Q6ZQ89 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
March6Q6ZQ89 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
March6Q6ZQ89 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
March6Q6ZQ89 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
March6Q6ZQ89 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
March6Q6ZQ89 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
March6Q6ZQ89 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
March6Q6ZQ89 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
March6Q6ZQ89 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
March6Q6ZQ89 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
March6Q6ZQ89 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
March6Q6ZQ89 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
March6Q6ZQ89 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
March6Q6ZQ89 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
March6Q6ZQ89 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
March6Q6ZQ89 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
March6Q6ZQ89 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
March6Q6ZQ89 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
March6Q6ZQ89 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
March6Q6ZQ89 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
March6Q6ZQ89 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
March6Q6ZQ89 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
March6Q6ZQ89 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
March6Q6ZQ89 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
March6Q6ZQ89 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
March6Q6ZQ89 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
March6Q6ZQ89 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
March6Q6ZQ89 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
March6Q6ZQ89 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
March6Q6ZQ89 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
March6Q6ZQ89 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
March6Q6ZQ89 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
March6Q6ZQ89 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
March6Q6ZQ89 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
March6Q6ZQ89 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
March6Q6ZQ89 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
March6Q6ZQ89 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
March6Q6ZQ89 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
March6Q6ZQ89 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
March6Q6ZQ89 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
March6Q6ZQ89 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
March6Q6ZQ89 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
March6Q6ZQ89 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
March6Q6ZQ89 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
March6Q6ZQ89 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
March6Q6ZQ89 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
March6Q6ZQ89 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
March6Q6ZQ89 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
March6Q6ZQ89 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
March6Q6ZQ89 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
March6Q6ZQ89 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
March6Q6ZQ89 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
March6Q6ZQ89 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
March6Q6ZQ89 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
March6Q6ZQ89 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
March6Q6ZQ89 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
March6Q6ZQ89 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
March6Q6ZQ89 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
March6Q6ZQ89 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
March6Q6ZQ89 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
March6Q6ZQ89 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
March6Q6ZQ89 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
March6Q6ZQ89 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms