Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NinlQ6ZQ12 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NinlQ6ZQ12 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NinlQ6ZQ12 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NinlQ6ZQ12 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NinlQ6ZQ12 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NinlQ6ZQ12 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NinlQ6ZQ12 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NinlQ6ZQ12 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NinlQ6ZQ12 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NinlQ6ZQ12 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NinlQ6ZQ12 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NinlQ6ZQ12 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NinlQ6ZQ12 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NinlQ6ZQ12 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NinlQ6ZQ12 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NinlQ6ZQ12 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NinlQ6ZQ12 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NinlQ6ZQ12 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NinlQ6ZQ12 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NinlQ6ZQ12 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NinlQ6ZQ12 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NinlQ6ZQ12 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NinlQ6ZQ12 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NinlQ6ZQ12 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NinlQ6ZQ12 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NinlQ6ZQ12 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NinlQ6ZQ12 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
NinlQ6ZQ12 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NinlQ6ZQ12 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NinlQ6ZQ12 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NinlQ6ZQ12 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NinlQ6ZQ12 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NinlQ6ZQ12 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NinlQ6ZQ12 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NinlQ6ZQ12 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NinlQ6ZQ12 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NinlQ6ZQ12 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NinlQ6ZQ12 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NinlQ6ZQ12 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NinlQ6ZQ12 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NinlQ6ZQ12 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NinlQ6ZQ12 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NinlQ6ZQ12 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NinlQ6ZQ12 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NinlQ6ZQ12 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NinlQ6ZQ12 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NinlQ6ZQ12 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NinlQ6ZQ12 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NinlQ6ZQ12 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NinlQ6ZQ12 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NinlQ6ZQ12 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NinlQ6ZQ12 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NinlQ6ZQ12 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NinlQ6ZQ12 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NinlQ6ZQ12 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NinlQ6ZQ12 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NinlQ6ZQ12 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NinlQ6ZQ12 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NinlQ6ZQ12 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NinlQ6ZQ12 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NinlQ6ZQ12 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NinlQ6ZQ12 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NinlQ6ZQ12 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NinlQ6ZQ12 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NinlQ6ZQ12 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NinlQ6ZQ12 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NinlQ6ZQ12 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NinlQ6ZQ12 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NinlQ6ZQ12 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NinlQ6ZQ12 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NinlQ6ZQ12 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NinlQ6ZQ12 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NinlQ6ZQ12 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NinlQ6ZQ12 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NinlQ6ZQ12 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NinlQ6ZQ12 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NinlQ6ZQ12 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NinlQ6ZQ12 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NinlQ6ZQ12 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NinlQ6ZQ12 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NinlQ6ZQ12 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NinlQ6ZQ12 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NinlQ6ZQ12 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NinlQ6ZQ12 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NinlQ6ZQ12 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NinlQ6ZQ12 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NinlQ6ZQ12 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NinlQ6ZQ12 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NinlQ6ZQ12 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NinlQ6ZQ12 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NinlQ6ZQ12 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NinlQ6ZQ12 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NinlQ6ZQ12 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NinlQ6ZQ12 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NinlQ6ZQ12 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NinlQ6ZQ12 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NinlQ6ZQ12 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NinlQ6ZQ12 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NinlQ6ZQ12 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
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