Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Ift172Q6VH22 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ift172Q6VH22 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ift172Q6VH22 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ift172Q6VH22 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ift172Q6VH22 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ift172Q6VH22 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ift172Q6VH22 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ift172Q6VH22 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ift172Q6VH22 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ift172Q6VH22 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ift172Q6VH22 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ift172Q6VH22 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Ift172Q6VH22 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ift172Q6VH22 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ift172Q6VH22 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ift172Q6VH22 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ift172Q6VH22 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ift172Q6VH22 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ift172Q6VH22 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ift172Q6VH22 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ift172Q6VH22 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ift172Q6VH22 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ift172Q6VH22 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Ift172Q6VH22 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ift172Q6VH22 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ift172Q6VH22 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ift172Q6VH22 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ift172Q6VH22 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ift172Q6VH22 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ift172Q6VH22 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ift172Q6VH22 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Ift172Q6VH22 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ift172Q6VH22 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ift172Q6VH22 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ift172Q6VH22 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ift172Q6VH22 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ift172Q6VH22 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ift172Q6VH22 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ift172Q6VH22 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ift172Q6VH22 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Ift172Q6VH22 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ift172Q6VH22 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ift172Q6VH22 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ift172Q6VH22 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ift172Q6VH22 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ift172Q6VH22 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ift172Q6VH22 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Ift172Q6VH22 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ift172Q6VH22 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ift172Q6VH22 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ift172Q6VH22 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ift172Q6VH22 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ift172Q6VH22 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ift172Q6VH22 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ift172Q6VH22 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ift172Q6VH22 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ift172Q6VH22 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ift172Q6VH22 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ift172Q6VH22 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ift172Q6VH22 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ift172Q6VH22 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ift172Q6VH22 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ift172Q6VH22 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ift172Q6VH22 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ift172Q6VH22 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ift172Q6VH22 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ift172Q6VH22 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ift172Q6VH22 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ift172Q6VH22 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ift172Q6VH22 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ift172Q6VH22 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ift172Q6VH22 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ift172Q6VH22 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ift172Q6VH22 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ift172Q6VH22 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Ift172Q6VH22 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ift172Q6VH22 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ift172Q6VH22 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ift172Q6VH22 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ift172Q6VH22 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ift172Q6VH22 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ift172Q6VH22 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ift172Q6VH22 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ift172Q6VH22 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ift172Q6VH22 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ift172Q6VH22 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ift172Q6VH22 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ift172Q6VH22 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ift172Q6VH22 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ift172Q6VH22 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ift172Q6VH22 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Ift172Q6VH22 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ift172Q6VH22 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ift172Q6VH22 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ift172Q6VH22 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ift172Q6VH22 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ift172Q6VH22 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Ift172Q6VH22 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ift172Q6VH22 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms