Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc88cQ6VGS5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc88cQ6VGS5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc88cQ6VGS5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc88cQ6VGS5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc88cQ6VGS5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc88cQ6VGS5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc88cQ6VGS5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc88cQ6VGS5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc88cQ6VGS5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc88cQ6VGS5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc88cQ6VGS5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc88cQ6VGS5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc88cQ6VGS5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms