Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF5

Bms1, BMS1 homolog, ribosome assembly protein (Yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bms1Q6PGF5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Bms1Q6PGF5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Bms1Q6PGF5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bms1Q6PGF5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Bms1Q6PGF5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bms1Q6PGF5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bms1Q6PGF5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bms1Q6PGF5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bms1Q6PGF5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bms1Q6PGF5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bms1Q6PGF5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bms1Q6PGF5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Bms1Q6PGF5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Bms1Q6PGF5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Bms1Q6PGF5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Bms1Q6PGF5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Bms1Q6PGF5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Bms1Q6PGF5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Bms1Q6PGF5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Bms1Q6PGF5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Bms1Q6PGF5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Bms1Q6PGF5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Bms1Q6PGF5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Bms1Q6PGF5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Bms1Q6PGF5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Bms1Q6PGF5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Bms1Q6PGF5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Bms1Q6PGF5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Bms1Q6PGF5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Bms1Q6PGF5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Bms1Q6PGF5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Bms1Q6PGF5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Bms1Q6PGF5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Bms1Q6PGF5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Bms1Q6PGF5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bms1Q6PGF5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bms1Q6PGF5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bms1Q6PGF5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bms1Q6PGF5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bms1Q6PGF5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Bms1Q6PGF5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Bms1Q6PGF5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Bms1Q6PGF5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Bms1Q6PGF5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Bms1Q6PGF5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bms1Q6PGF5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bms1Q6PGF5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bms1Q6PGF5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bms1Q6PGF5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bms1Q6PGF5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bms1Q6PGF5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bms1Q6PGF5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bms1Q6PGF5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bms1Q6PGF5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bms1Q6PGF5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Bms1Q6PGF5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Bms1Q6PGF5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Bms1Q6PGF5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Bms1Q6PGF5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Bms1Q6PGF5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Bms1Q6PGF5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Bms1Q6PGF5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bms1Q6PGF5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bms1Q6PGF5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bms1Q6PGF5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bms1Q6PGF5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bms1Q6PGF5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bms1Q6PGF5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bms1Q6PGF5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bms1Q6PGF5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bms1Q6PGF5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bms1Q6PGF5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bms1Q6PGF5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bms1Q6PGF5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Bms1Q6PGF5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bms1Q6PGF5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bms1Q6PGF5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bms1Q6PGF5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bms1Q6PGF5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bms1Q6PGF5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Bms1Q6PGF5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bms1Q6PGF5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bms1Q6PGF5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bms1Q6PGF5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bms1Q6PGF5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bms1Q6PGF5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bms1Q6PGF5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bms1Q6PGF5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bms1Q6PGF5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bms1Q6PGF5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bms1Q6PGF5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Bms1Q6PGF5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Bms1Q6PGF5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Bms1Q6PGF5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Bms1Q6PGF5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Bms1Q6PGF5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Bms1Q6PGF5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Bms1Q6PGF5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Bms1Q6PGF5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Bms1Q6PGF5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms