Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HjurpQ6PG16 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HjurpQ6PG16 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HjurpQ6PG16 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HjurpQ6PG16 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HjurpQ6PG16 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HjurpQ6PG16 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HjurpQ6PG16 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HjurpQ6PG16 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HjurpQ6PG16 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HjurpQ6PG16 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HjurpQ6PG16 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HjurpQ6PG16 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HjurpQ6PG16 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HjurpQ6PG16 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HjurpQ6PG16 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HjurpQ6PG16 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HjurpQ6PG16 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HjurpQ6PG16 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HjurpQ6PG16 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HjurpQ6PG16 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HjurpQ6PG16 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HjurpQ6PG16 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HjurpQ6PG16 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HjurpQ6PG16 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HjurpQ6PG16 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HjurpQ6PG16 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HjurpQ6PG16 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HjurpQ6PG16 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HjurpQ6PG16 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HjurpQ6PG16 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HjurpQ6PG16 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HjurpQ6PG16 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HjurpQ6PG16 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HjurpQ6PG16 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HjurpQ6PG16 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HjurpQ6PG16 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HjurpQ6PG16 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HjurpQ6PG16 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HjurpQ6PG16 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HjurpQ6PG16 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HjurpQ6PG16 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HjurpQ6PG16 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HjurpQ6PG16 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HjurpQ6PG16 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HjurpQ6PG16 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HjurpQ6PG16 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HjurpQ6PG16 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HjurpQ6PG16 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HjurpQ6PG16 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HjurpQ6PG16 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HjurpQ6PG16 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HjurpQ6PG16 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HjurpQ6PG16 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HjurpQ6PG16 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HjurpQ6PG16 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HjurpQ6PG16 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HjurpQ6PG16 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HjurpQ6PG16 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HjurpQ6PG16 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HjurpQ6PG16 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HjurpQ6PG16 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HjurpQ6PG16 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HjurpQ6PG16 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HjurpQ6PG16 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HjurpQ6PG16 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HjurpQ6PG16 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HjurpQ6PG16 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HjurpQ6PG16 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HjurpQ6PG16 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HjurpQ6PG16 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HjurpQ6PG16 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HjurpQ6PG16 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HjurpQ6PG16 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HjurpQ6PG16 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HjurpQ6PG16 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HjurpQ6PG16 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HjurpQ6PG16 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HjurpQ6PG16 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HjurpQ6PG16 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HjurpQ6PG16 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HjurpQ6PG16 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HjurpQ6PG16 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HjurpQ6PG16 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HjurpQ6PG16 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HjurpQ6PG16 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HjurpQ6PG16 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HjurpQ6PG16 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HjurpQ6PG16 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HjurpQ6PG16 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HjurpQ6PG16 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HjurpQ6PG16 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HjurpQ6PG16 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HjurpQ6PG16 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HjurpQ6PG16 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HjurpQ6PG16 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HjurpQ6PG16 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HjurpQ6PG16 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HjurpQ6PG16 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HjurpQ6PG16 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms