Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Chd4Q6PDQ2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Chd4Q6PDQ2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Chd4Q6PDQ2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Chd4Q6PDQ2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Chd4Q6PDQ2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Chd4Q6PDQ2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Chd4Q6PDQ2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Chd4Q6PDQ2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Chd4Q6PDQ2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Chd4Q6PDQ2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Chd4Q6PDQ2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Chd4Q6PDQ2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Chd4Q6PDQ2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Chd4Q6PDQ2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Chd4Q6PDQ2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Chd4Q6PDQ2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Chd4Q6PDQ2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Chd4Q6PDQ2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Chd4Q6PDQ2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Chd4Q6PDQ2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Chd4Q6PDQ2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Chd4Q6PDQ2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Chd4Q6PDQ2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Chd4Q6PDQ2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Chd4Q6PDQ2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Chd4Q6PDQ2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Chd4Q6PDQ2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Chd4Q6PDQ2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Chd4Q6PDQ2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Chd4Q6PDQ2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Chd4Q6PDQ2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Chd4Q6PDQ2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Chd4Q6PDQ2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Chd4Q6PDQ2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Chd4Q6PDQ2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Chd4Q6PDQ2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Chd4Q6PDQ2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Chd4Q6PDQ2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Chd4Q6PDQ2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Chd4Q6PDQ2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Chd4Q6PDQ2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Chd4Q6PDQ2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Chd4Q6PDQ2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Chd4Q6PDQ2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Chd4Q6PDQ2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Chd4Q6PDQ2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Chd4Q6PDQ2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Chd4Q6PDQ2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Chd4Q6PDQ2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Chd4Q6PDQ2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Chd4Q6PDQ2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Chd4Q6PDQ2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Chd4Q6PDQ2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Chd4Q6PDQ2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Chd4Q6PDQ2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Chd4Q6PDQ2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
Chd4Q6PDQ2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Chd4Q6PDQ2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Chd4Q6PDQ2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Chd4Q6PDQ2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Chd4Q6PDQ2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Chd4Q6PDQ2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Chd4Q6PDQ2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Chd4Q6PDQ2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Chd4Q6PDQ2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chd4Q6PDQ2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chd4Q6PDQ2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chd4Q6PDQ2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chd4Q6PDQ2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chd4Q6PDQ2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chd4Q6PDQ2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chd4Q6PDQ2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chd4Q6PDQ2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Chd4Q6PDQ2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chd4Q6PDQ2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chd4Q6PDQ2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chd4Q6PDQ2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chd4Q6PDQ2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chd4Q6PDQ2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chd4Q6PDQ2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chd4Q6PDQ2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chd4Q6PDQ2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chd4Q6PDQ2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chd4Q6PDQ2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chd4Q6PDQ2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chd4Q6PDQ2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Chd4Q6PDQ2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Chd4Q6PDQ2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Chd4Q6PDQ2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Chd4Q6PDQ2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Chd4Q6PDQ2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Chd4Q6PDQ2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Chd4Q6PDQ2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Chd4Q6PDQ2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Chd4Q6PDQ2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Chd4Q6PDQ2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Chd4Q6PDQ2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Chd4Q6PDQ2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Chd4Q6PDQ2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms