Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM4

Ccdc36, Interactor of HORMAD1 protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc36Q6PDM4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc36Q6PDM4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc36Q6PDM4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc36Q6PDM4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc36Q6PDM4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc36Q6PDM4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc36Q6PDM4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc36Q6PDM4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc36Q6PDM4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc36Q6PDM4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc36Q6PDM4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc36Q6PDM4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc36Q6PDM4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc36Q6PDM4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc36Q6PDM4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc36Q6PDM4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc36Q6PDM4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc36Q6PDM4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc36Q6PDM4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc36Q6PDM4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc36Q6PDM4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc36Q6PDM4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc36Q6PDM4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc36Q6PDM4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc36Q6PDM4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc36Q6PDM4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc36Q6PDM4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc36Q6PDM4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc36Q6PDM4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc36Q6PDM4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc36Q6PDM4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc36Q6PDM4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc36Q6PDM4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc36Q6PDM4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc36Q6PDM4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc36Q6PDM4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc36Q6PDM4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc36Q6PDM4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc36Q6PDM4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc36Q6PDM4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc36Q6PDM4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc36Q6PDM4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc36Q6PDM4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc36Q6PDM4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc36Q6PDM4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc36Q6PDM4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc36Q6PDM4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc36Q6PDM4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc36Q6PDM4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc36Q6PDM4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc36Q6PDM4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc36Q6PDM4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc36Q6PDM4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc36Q6PDM4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc36Q6PDM4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc36Q6PDM4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc36Q6PDM4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc36Q6PDM4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc36Q6PDM4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc36Q6PDM4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc36Q6PDM4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc36Q6PDM4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc36Q6PDM4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc36Q6PDM4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc36Q6PDM4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc36Q6PDM4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc36Q6PDM4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc36Q6PDM4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc36Q6PDM4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc36Q6PDM4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc36Q6PDM4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc36Q6PDM4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc36Q6PDM4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc36Q6PDM4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc36Q6PDM4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc36Q6PDM4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc36Q6PDM4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc36Q6PDM4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc36Q6PDM4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc36Q6PDM4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc36Q6PDM4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc36Q6PDM4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc36Q6PDM4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc36Q6PDM4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc36Q6PDM4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc36Q6PDM4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc36Q6PDM4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc36Q6PDM4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc36Q6PDM4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc36Q6PDM4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc36Q6PDM4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc36Q6PDM4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc36Q6PDM4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc36Q6PDM4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc36Q6PDM4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc36Q6PDM4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc36Q6PDM4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc36Q6PDM4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc36Q6PDM4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc36Q6PDM4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.2 ms