Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms