Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Herc4Q6PAV2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Herc4Q6PAV2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Herc4Q6PAV2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Herc4Q6PAV2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Herc4Q6PAV2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Herc4Q6PAV2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Herc4Q6PAV2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Herc4Q6PAV2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Herc4Q6PAV2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Herc4Q6PAV2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Herc4Q6PAV2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Herc4Q6PAV2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Herc4Q6PAV2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Herc4Q6PAV2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Herc4Q6PAV2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Herc4Q6PAV2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Herc4Q6PAV2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Herc4Q6PAV2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Herc4Q6PAV2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Herc4Q6PAV2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Herc4Q6PAV2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Herc4Q6PAV2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Herc4Q6PAV2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Herc4Q6PAV2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Herc4Q6PAV2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Herc4Q6PAV2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Herc4Q6PAV2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Herc4Q6PAV2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Herc4Q6PAV2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Herc4Q6PAV2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Herc4Q6PAV2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Herc4Q6PAV2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Herc4Q6PAV2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Herc4Q6PAV2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Herc4Q6PAV2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Herc4Q6PAV2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Herc4Q6PAV2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Herc4Q6PAV2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Herc4Q6PAV2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Herc4Q6PAV2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Herc4Q6PAV2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Herc4Q6PAV2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Herc4Q6PAV2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Herc4Q6PAV2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Herc4Q6PAV2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Herc4Q6PAV2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Herc4Q6PAV2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Herc4Q6PAV2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Herc4Q6PAV2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Herc4Q6PAV2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Herc4Q6PAV2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Herc4Q6PAV2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Herc4Q6PAV2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Herc4Q6PAV2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Herc4Q6PAV2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Herc4Q6PAV2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Herc4Q6PAV2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Herc4Q6PAV2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Herc4Q6PAV2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Herc4Q6PAV2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Herc4Q6PAV2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Herc4Q6PAV2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Herc4Q6PAV2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Herc4Q6PAV2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Herc4Q6PAV2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Herc4Q6PAV2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Herc4Q6PAV2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Herc4Q6PAV2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Herc4Q6PAV2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Herc4Q6PAV2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Herc4Q6PAV2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Herc4Q6PAV2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Herc4Q6PAV2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Herc4Q6PAV2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Herc4Q6PAV2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Herc4Q6PAV2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Herc4Q6PAV2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Herc4Q6PAV2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Herc4Q6PAV2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Herc4Q6PAV2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Herc4Q6PAV2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Herc4Q6PAV2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Herc4Q6PAV2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Herc4Q6PAV2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Herc4Q6PAV2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Herc4Q6PAV2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Herc4Q6PAV2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Herc4Q6PAV2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Herc4Q6PAV2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Herc4Q6PAV2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Herc4Q6PAV2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Herc4Q6PAV2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Herc4Q6PAV2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Herc4Q6PAV2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Herc4Q6PAV2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Herc4Q6PAV2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Herc4Q6PAV2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Herc4Q6PAV2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Herc4Q6PAV2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms