Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T1

Snx19, Sorting nexin-19, mousemouse

Predictions only

Length 997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx19Q6P4T1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx19Q6P4T1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx19Q6P4T1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx19Q6P4T1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx19Q6P4T1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx19Q6P4T1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx19Q6P4T1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx19Q6P4T1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx19Q6P4T1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx19Q6P4T1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx19Q6P4T1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx19Q6P4T1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx19Q6P4T1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx19Q6P4T1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx19Q6P4T1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx19Q6P4T1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx19Q6P4T1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx19Q6P4T1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx19Q6P4T1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx19Q6P4T1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx19Q6P4T1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx19Q6P4T1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx19Q6P4T1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx19Q6P4T1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx19Q6P4T1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx19Q6P4T1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx19Q6P4T1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx19Q6P4T1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx19Q6P4T1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx19Q6P4T1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx19Q6P4T1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx19Q6P4T1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx19Q6P4T1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx19Q6P4T1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx19Q6P4T1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx19Q6P4T1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx19Q6P4T1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx19Q6P4T1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx19Q6P4T1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx19Q6P4T1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx19Q6P4T1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx19Q6P4T1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx19Q6P4T1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx19Q6P4T1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx19Q6P4T1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx19Q6P4T1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx19Q6P4T1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx19Q6P4T1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx19Q6P4T1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx19Q6P4T1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx19Q6P4T1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx19Q6P4T1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx19Q6P4T1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx19Q6P4T1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx19Q6P4T1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx19Q6P4T1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx19Q6P4T1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx19Q6P4T1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx19Q6P4T1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx19Q6P4T1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx19Q6P4T1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx19Q6P4T1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx19Q6P4T1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx19Q6P4T1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx19Q6P4T1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx19Q6P4T1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx19Q6P4T1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx19Q6P4T1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx19Q6P4T1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx19Q6P4T1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx19Q6P4T1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx19Q6P4T1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx19Q6P4T1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx19Q6P4T1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx19Q6P4T1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx19Q6P4T1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx19Q6P4T1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx19Q6P4T1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx19Q6P4T1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx19Q6P4T1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx19Q6P4T1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx19Q6P4T1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx19Q6P4T1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx19Q6P4T1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx19Q6P4T1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx19Q6P4T1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx19Q6P4T1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx19Q6P4T1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx19Q6P4T1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx19Q6P4T1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx19Q6P4T1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx19Q6P4T1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx19Q6P4T1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx19Q6P4T1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx19Q6P4T1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx19Q6P4T1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx19Q6P4T1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx19Q6P4T1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx19Q6P4T1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx19Q6P4T1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms