Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4S6

Sik3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, mousemouse

Predictions only

Length 1,311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik3Q6P4S6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sik3Q6P4S6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sik3Q6P4S6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sik3Q6P4S6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sik3Q6P4S6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sik3Q6P4S6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sik3Q6P4S6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sik3Q6P4S6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sik3Q6P4S6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sik3Q6P4S6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sik3Q6P4S6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sik3Q6P4S6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sik3Q6P4S6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Sik3Q6P4S6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sik3Q6P4S6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Sik3Q6P4S6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sik3Q6P4S6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sik3Q6P4S6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sik3Q6P4S6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sik3Q6P4S6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sik3Q6P4S6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sik3Q6P4S6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Sik3Q6P4S6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sik3Q6P4S6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sik3Q6P4S6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sik3Q6P4S6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sik3Q6P4S6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sik3Q6P4S6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sik3Q6P4S6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sik3Q6P4S6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sik3Q6P4S6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sik3Q6P4S6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sik3Q6P4S6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sik3Q6P4S6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sik3Q6P4S6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Sik3Q6P4S6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sik3Q6P4S6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sik3Q6P4S6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sik3Q6P4S6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sik3Q6P4S6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sik3Q6P4S6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sik3Q6P4S6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sik3Q6P4S6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Sik3Q6P4S6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sik3Q6P4S6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sik3Q6P4S6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sik3Q6P4S6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sik3Q6P4S6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sik3Q6P4S6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sik3Q6P4S6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sik3Q6P4S6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sik3Q6P4S6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sik3Q6P4S6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sik3Q6P4S6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sik3Q6P4S6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sik3Q6P4S6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Sik3Q6P4S6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sik3Q6P4S6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Sik3Q6P4S6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sik3Q6P4S6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sik3Q6P4S6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sik3Q6P4S6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Sik3Q6P4S6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sik3Q6P4S6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sik3Q6P4S6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sik3Q6P4S6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Sik3Q6P4S6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sik3Q6P4S6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sik3Q6P4S6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sik3Q6P4S6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Sik3Q6P4S6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sik3Q6P4S6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sik3Q6P4S6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sik3Q6P4S6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sik3Q6P4S6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sik3Q6P4S6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sik3Q6P4S6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sik3Q6P4S6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sik3Q6P4S6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sik3Q6P4S6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sik3Q6P4S6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sik3Q6P4S6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sik3Q6P4S6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sik3Q6P4S6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sik3Q6P4S6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sik3Q6P4S6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sik3Q6P4S6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sik3Q6P4S6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sik3Q6P4S6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sik3Q6P4S6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sik3Q6P4S6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sik3Q6P4S6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sik3Q6P4S6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sik3Q6P4S6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Sik3Q6P4S6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sik3Q6P4S6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sik3Q6P4S6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sik3Q6P4S6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sik3Q6P4S6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sik3Q6P4S6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms