Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Podnl1Q6P3Y9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Podnl1Q6P3Y9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Podnl1Q6P3Y9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Podnl1Q6P3Y9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Podnl1Q6P3Y9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Podnl1Q6P3Y9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Podnl1Q6P3Y9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Podnl1Q6P3Y9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Podnl1Q6P3Y9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Podnl1Q6P3Y9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Podnl1Q6P3Y9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Podnl1Q6P3Y9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Podnl1Q6P3Y9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Podnl1Q6P3Y9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Podnl1Q6P3Y9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Podnl1Q6P3Y9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Podnl1Q6P3Y9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Podnl1Q6P3Y9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Podnl1Q6P3Y9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Podnl1Q6P3Y9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Podnl1Q6P3Y9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Podnl1Q6P3Y9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Podnl1Q6P3Y9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Podnl1Q6P3Y9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Podnl1Q6P3Y9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Podnl1Q6P3Y9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Podnl1Q6P3Y9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Podnl1Q6P3Y9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Podnl1Q6P3Y9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Podnl1Q6P3Y9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Podnl1Q6P3Y9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Podnl1Q6P3Y9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Podnl1Q6P3Y9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Podnl1Q6P3Y9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Podnl1Q6P3Y9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Podnl1Q6P3Y9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Podnl1Q6P3Y9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Podnl1Q6P3Y9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Podnl1Q6P3Y9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Podnl1Q6P3Y9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Podnl1Q6P3Y9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Podnl1Q6P3Y9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Podnl1Q6P3Y9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Podnl1Q6P3Y9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Podnl1Q6P3Y9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Podnl1Q6P3Y9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Podnl1Q6P3Y9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Podnl1Q6P3Y9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Podnl1Q6P3Y9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Podnl1Q6P3Y9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Podnl1Q6P3Y9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Podnl1Q6P3Y9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Podnl1Q6P3Y9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Podnl1Q6P3Y9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Podnl1Q6P3Y9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Podnl1Q6P3Y9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Podnl1Q6P3Y9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Podnl1Q6P3Y9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Podnl1Q6P3Y9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Podnl1Q6P3Y9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Podnl1Q6P3Y9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Podnl1Q6P3Y9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Podnl1Q6P3Y9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Podnl1Q6P3Y9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Podnl1Q6P3Y9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Podnl1Q6P3Y9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Podnl1Q6P3Y9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Podnl1Q6P3Y9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Podnl1Q6P3Y9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Podnl1Q6P3Y9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Podnl1Q6P3Y9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Podnl1Q6P3Y9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Podnl1Q6P3Y9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Podnl1Q6P3Y9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Podnl1Q6P3Y9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Podnl1Q6P3Y9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Podnl1Q6P3Y9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Podnl1Q6P3Y9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Podnl1Q6P3Y9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Podnl1Q6P3Y9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Podnl1Q6P3Y9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Podnl1Q6P3Y9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Podnl1Q6P3Y9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Podnl1Q6P3Y9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Podnl1Q6P3Y9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Podnl1Q6P3Y9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Podnl1Q6P3Y9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Podnl1Q6P3Y9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Podnl1Q6P3Y9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Podnl1Q6P3Y9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Podnl1Q6P3Y9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Podnl1Q6P3Y9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Podnl1Q6P3Y9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Podnl1Q6P3Y9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Podnl1Q6P3Y9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Podnl1Q6P3Y9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Podnl1Q6P3Y9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Podnl1Q6P3Y9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Podnl1Q6P3Y9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms