Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3E7

Hdac10, Histone deacetylase 10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac10Q6P3E7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac10Q6P3E7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac10Q6P3E7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac10Q6P3E7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac10Q6P3E7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac10Q6P3E7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac10Q6P3E7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac10Q6P3E7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac10Q6P3E7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac10Q6P3E7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac10Q6P3E7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac10Q6P3E7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac10Q6P3E7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac10Q6P3E7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac10Q6P3E7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac10Q6P3E7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac10Q6P3E7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac10Q6P3E7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac10Q6P3E7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac10Q6P3E7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac10Q6P3E7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac10Q6P3E7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac10Q6P3E7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac10Q6P3E7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hdac10Q6P3E7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hdac10Q6P3E7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hdac10Q6P3E7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac10Q6P3E7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac10Q6P3E7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac10Q6P3E7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac10Q6P3E7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac10Q6P3E7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac10Q6P3E7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac10Q6P3E7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac10Q6P3E7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac10Q6P3E7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac10Q6P3E7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac10Q6P3E7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac10Q6P3E7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac10Q6P3E7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac10Q6P3E7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac10Q6P3E7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac10Q6P3E7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac10Q6P3E7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac10Q6P3E7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac10Q6P3E7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac10Q6P3E7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac10Q6P3E7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac10Q6P3E7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac10Q6P3E7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac10Q6P3E7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac10Q6P3E7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac10Q6P3E7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac10Q6P3E7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac10Q6P3E7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac10Q6P3E7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac10Q6P3E7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac10Q6P3E7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac10Q6P3E7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac10Q6P3E7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac10Q6P3E7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac10Q6P3E7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Hdac10Q6P3E7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Hdac10Q6P3E7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac10Q6P3E7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac10Q6P3E7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac10Q6P3E7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac10Q6P3E7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac10Q6P3E7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac10Q6P3E7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac10Q6P3E7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac10Q6P3E7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac10Q6P3E7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac10Q6P3E7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac10Q6P3E7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac10Q6P3E7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac10Q6P3E7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac10Q6P3E7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac10Q6P3E7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac10Q6P3E7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac10Q6P3E7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac10Q6P3E7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac10Q6P3E7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac10Q6P3E7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac10Q6P3E7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac10Q6P3E7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac10Q6P3E7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac10Q6P3E7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac10Q6P3E7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac10Q6P3E7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac10Q6P3E7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac10Q6P3E7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac10Q6P3E7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac10Q6P3E7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac10Q6P3E7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac10Q6P3E7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac10Q6P3E7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac10Q6P3E7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac10Q6P3E7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac10Q6P3E7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.8 ms