Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Slx4Q6P1D7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Slx4Q6P1D7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Slx4Q6P1D7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Slx4Q6P1D7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Slx4Q6P1D7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Slx4Q6P1D7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Slx4Q6P1D7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Slx4Q6P1D7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Slx4Q6P1D7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Slx4Q6P1D7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Slx4Q6P1D7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Slx4Q6P1D7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Slx4Q6P1D7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Slx4Q6P1D7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Slx4Q6P1D7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Slx4Q6P1D7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Slx4Q6P1D7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Slx4Q6P1D7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Slx4Q6P1D7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Slx4Q6P1D7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Slx4Q6P1D7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Slx4Q6P1D7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Slx4Q6P1D7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Slx4Q6P1D7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Slx4Q6P1D7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Slx4Q6P1D7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Slx4Q6P1D7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Slx4Q6P1D7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Slx4Q6P1D7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Slx4Q6P1D7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Slx4Q6P1D7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Slx4Q6P1D7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Slx4Q6P1D7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Slx4Q6P1D7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Slx4Q6P1D7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Slx4Q6P1D7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Slx4Q6P1D7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Slx4Q6P1D7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Slx4Q6P1D7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Slx4Q6P1D7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Slx4Q6P1D7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Slx4Q6P1D7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Slx4Q6P1D7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Slx4Q6P1D7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Slx4Q6P1D7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Slx4Q6P1D7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Slx4Q6P1D7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Slx4Q6P1D7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Slx4Q6P1D7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Slx4Q6P1D7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Slx4Q6P1D7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Slx4Q6P1D7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Slx4Q6P1D7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Slx4Q6P1D7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Slx4Q6P1D7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Slx4Q6P1D7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Slx4Q6P1D7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Slx4Q6P1D7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Slx4Q6P1D7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Slx4Q6P1D7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Slx4Q6P1D7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
Slx4Q6P1D7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
Slx4Q6P1D7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Slx4Q6P1D7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Slx4Q6P1D7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Slx4Q6P1D7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Slx4Q6P1D7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Slx4Q6P1D7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Slx4Q6P1D7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Slx4Q6P1D7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Slx4Q6P1D7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Slx4Q6P1D7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Slx4Q6P1D7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Slx4Q6P1D7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Slx4Q6P1D7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Slx4Q6P1D7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Slx4Q6P1D7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Slx4Q6P1D7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Slx4Q6P1D7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Slx4Q6P1D7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Slx4Q6P1D7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Slx4Q6P1D7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Slx4Q6P1D7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Slx4Q6P1D7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Slx4Q6P1D7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Slx4Q6P1D7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Slx4Q6P1D7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Slx4Q6P1D7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Slx4Q6P1D7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Slx4Q6P1D7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Slx4Q6P1D7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Slx4Q6P1D7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Slx4Q6P1D7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Slx4Q6P1D7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Slx4Q6P1D7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Slx4Q6P1D7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Slx4Q6P1D7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Slx4Q6P1D7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Slx4Q6P1D7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms