Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZK8

Ptpdc1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpdc1Q6NZK8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ptpdc1Q6NZK8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ptpdc1Q6NZK8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ptpdc1Q6NZK8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ptpdc1Q6NZK8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ptpdc1Q6NZK8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ptpdc1Q6NZK8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ptpdc1Q6NZK8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ptpdc1Q6NZK8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ptpdc1Q6NZK8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ptpdc1Q6NZK8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ptpdc1Q6NZK8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ptpdc1Q6NZK8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ptpdc1Q6NZK8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ptpdc1Q6NZK8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ptpdc1Q6NZK8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ptpdc1Q6NZK8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ptpdc1Q6NZK8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ptpdc1Q6NZK8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ptpdc1Q6NZK8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ptpdc1Q6NZK8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ptpdc1Q6NZK8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ptpdc1Q6NZK8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ptpdc1Q6NZK8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ptpdc1Q6NZK8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ptpdc1Q6NZK8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ptpdc1Q6NZK8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ptpdc1Q6NZK8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ptpdc1Q6NZK8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ptpdc1Q6NZK8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ptpdc1Q6NZK8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ptpdc1Q6NZK8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ptpdc1Q6NZK8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ptpdc1Q6NZK8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ptpdc1Q6NZK8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ptpdc1Q6NZK8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ptpdc1Q6NZK8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ptpdc1Q6NZK8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ptpdc1Q6NZK8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ptpdc1Q6NZK8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ptpdc1Q6NZK8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ptpdc1Q6NZK8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ptpdc1Q6NZK8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ptpdc1Q6NZK8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms