Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rprd2Q6NXI6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Rprd2Q6NXI6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Rprd2Q6NXI6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rprd2Q6NXI6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Rprd2Q6NXI6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rprd2Q6NXI6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rprd2Q6NXI6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rprd2Q6NXI6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rprd2Q6NXI6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rprd2Q6NXI6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rprd2Q6NXI6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rprd2Q6NXI6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Rprd2Q6NXI6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Rprd2Q6NXI6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rprd2Q6NXI6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rprd2Q6NXI6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rprd2Q6NXI6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rprd2Q6NXI6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rprd2Q6NXI6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rprd2Q6NXI6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rprd2Q6NXI6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rprd2Q6NXI6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rprd2Q6NXI6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Rprd2Q6NXI6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rprd2Q6NXI6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Rprd2Q6NXI6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rprd2Q6NXI6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rprd2Q6NXI6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rprd2Q6NXI6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rprd2Q6NXI6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rprd2Q6NXI6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rprd2Q6NXI6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rprd2Q6NXI6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rprd2Q6NXI6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rprd2Q6NXI6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Rprd2Q6NXI6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rprd2Q6NXI6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rprd2Q6NXI6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rprd2Q6NXI6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rprd2Q6NXI6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rprd2Q6NXI6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rprd2Q6NXI6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rprd2Q6NXI6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rprd2Q6NXI6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rprd2Q6NXI6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rprd2Q6NXI6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rprd2Q6NXI6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rprd2Q6NXI6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rprd2Q6NXI6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rprd2Q6NXI6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rprd2Q6NXI6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Rprd2Q6NXI6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Rprd2Q6NXI6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Rprd2Q6NXI6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Rprd2Q6NXI6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Rprd2Q6NXI6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rprd2Q6NXI6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Rprd2Q6NXI6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Rprd2Q6NXI6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rprd2Q6NXI6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rprd2Q6NXI6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rprd2Q6NXI6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rprd2Q6NXI6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rprd2Q6NXI6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rprd2Q6NXI6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rprd2Q6NXI6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rprd2Q6NXI6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rprd2Q6NXI6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rprd2Q6NXI6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rprd2Q6NXI6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rprd2Q6NXI6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rprd2Q6NXI6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Rprd2Q6NXI6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rprd2Q6NXI6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rprd2Q6NXI6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rprd2Q6NXI6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rprd2Q6NXI6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rprd2Q6NXI6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rprd2Q6NXI6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rprd2Q6NXI6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rprd2Q6NXI6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Rprd2Q6NXI6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rprd2Q6NXI6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rprd2Q6NXI6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rprd2Q6NXI6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rprd2Q6NXI6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rprd2Q6NXI6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rprd2Q6NXI6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rprd2Q6NXI6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rprd2Q6NXI6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Rprd2Q6NXI6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rprd2Q6NXI6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rprd2Q6NXI6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rprd2Q6NXI6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rprd2Q6NXI6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rprd2Q6NXI6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rprd2Q6NXI6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rprd2Q6NXI6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rprd2Q6NXI6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms