Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fndc3bQ6NWW9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fndc3bQ6NWW9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fndc3bQ6NWW9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fndc3bQ6NWW9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fndc3bQ6NWW9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Fndc3bQ6NWW9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fndc3bQ6NWW9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fndc3bQ6NWW9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fndc3bQ6NWW9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fndc3bQ6NWW9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fndc3bQ6NWW9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fndc3bQ6NWW9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fndc3bQ6NWW9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fndc3bQ6NWW9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Fndc3bQ6NWW9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fndc3bQ6NWW9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fndc3bQ6NWW9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fndc3bQ6NWW9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fndc3bQ6NWW9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Fndc3bQ6NWW9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fndc3bQ6NWW9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fndc3bQ6NWW9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fndc3bQ6NWW9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fndc3bQ6NWW9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fndc3bQ6NWW9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fndc3bQ6NWW9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fndc3bQ6NWW9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fndc3bQ6NWW9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fndc3bQ6NWW9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fndc3bQ6NWW9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fndc3bQ6NWW9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Fndc3bQ6NWW9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fndc3bQ6NWW9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fndc3bQ6NWW9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fndc3bQ6NWW9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fndc3bQ6NWW9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fndc3bQ6NWW9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fndc3bQ6NWW9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fndc3bQ6NWW9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fndc3bQ6NWW9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Fndc3bQ6NWW9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fndc3bQ6NWW9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fndc3bQ6NWW9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fndc3bQ6NWW9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Fndc3bQ6NWW9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fndc3bQ6NWW9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fndc3bQ6NWW9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Fndc3bQ6NWW9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Fndc3bQ6NWW9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fndc3bQ6NWW9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fndc3bQ6NWW9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fndc3bQ6NWW9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fndc3bQ6NWW9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Fndc3bQ6NWW9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fndc3bQ6NWW9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fndc3bQ6NWW9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fndc3bQ6NWW9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fndc3bQ6NWW9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fndc3bQ6NWW9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fndc3bQ6NWW9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fndc3bQ6NWW9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Fndc3bQ6NWW9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fndc3bQ6NWW9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fndc3bQ6NWW9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fndc3bQ6NWW9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fndc3bQ6NWW9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fndc3bQ6NWW9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fndc3bQ6NWW9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fndc3bQ6NWW9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fndc3bQ6NWW9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fndc3bQ6NWW9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fndc3bQ6NWW9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fndc3bQ6NWW9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fndc3bQ6NWW9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fndc3bQ6NWW9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fndc3bQ6NWW9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fndc3bQ6NWW9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fndc3bQ6NWW9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fndc3bQ6NWW9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Fndc3bQ6NWW9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fndc3bQ6NWW9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fndc3bQ6NWW9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fndc3bQ6NWW9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fndc3bQ6NWW9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fndc3bQ6NWW9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fndc3bQ6NWW9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fndc3bQ6NWW9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fndc3bQ6NWW9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Fndc3bQ6NWW9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fndc3bQ6NWW9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fndc3bQ6NWW9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fndc3bQ6NWW9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fndc3bQ6NWW9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fndc3bQ6NWW9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fndc3bQ6NWW9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fndc3bQ6NWW9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fndc3bQ6NWW9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fndc3bQ6NWW9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fndc3bQ6NWW9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms