Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cpsf6Q6NVF9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cpsf6Q6NVF9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cpsf6Q6NVF9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpsf6Q6NVF9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpsf6Q6NVF9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpsf6Q6NVF9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpsf6Q6NVF9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpsf6Q6NVF9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpsf6Q6NVF9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpsf6Q6NVF9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpsf6Q6NVF9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cpsf6Q6NVF9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cpsf6Q6NVF9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cpsf6Q6NVF9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cpsf6Q6NVF9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cpsf6Q6NVF9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cpsf6Q6NVF9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cpsf6Q6NVF9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cpsf6Q6NVF9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cpsf6Q6NVF9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Cpsf6Q6NVF9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cpsf6Q6NVF9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cpsf6Q6NVF9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cpsf6Q6NVF9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpsf6Q6NVF9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpsf6Q6NVF9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpsf6Q6NVF9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpsf6Q6NVF9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpsf6Q6NVF9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpsf6Q6NVF9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpsf6Q6NVF9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpsf6Q6NVF9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpsf6Q6NVF9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpsf6Q6NVF9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpsf6Q6NVF9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpsf6Q6NVF9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpsf6Q6NVF9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpsf6Q6NVF9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpsf6Q6NVF9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpsf6Q6NVF9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpsf6Q6NVF9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpsf6Q6NVF9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpsf6Q6NVF9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpsf6Q6NVF9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpsf6Q6NVF9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpsf6Q6NVF9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpsf6Q6NVF9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpsf6Q6NVF9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpsf6Q6NVF9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpsf6Q6NVF9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cpsf6Q6NVF9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cpsf6Q6NVF9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cpsf6Q6NVF9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cpsf6Q6NVF9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cpsf6Q6NVF9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cpsf6Q6NVF9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cpsf6Q6NVF9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cpsf6Q6NVF9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cpsf6Q6NVF9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cpsf6Q6NVF9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cpsf6Q6NVF9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cpsf6Q6NVF9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cpsf6Q6NVF9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cpsf6Q6NVF9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cpsf6Q6NVF9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cpsf6Q6NVF9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cpsf6Q6NVF9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Cpsf6Q6NVF9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cpsf6Q6NVF9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cpsf6Q6NVF9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cpsf6Q6NVF9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cpsf6Q6NVF9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cpsf6Q6NVF9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cpsf6Q6NVF9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cpsf6Q6NVF9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cpsf6Q6NVF9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Cpsf6Q6NVF9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cpsf6Q6NVF9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cpsf6Q6NVF9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cpsf6Q6NVF9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cpsf6Q6NVF9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cpsf6Q6NVF9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cpsf6Q6NVF9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cpsf6Q6NVF9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cpsf6Q6NVF9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cpsf6Q6NVF9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cpsf6Q6NVF9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cpsf6Q6NVF9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cpsf6Q6NVF9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cpsf6Q6NVF9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cpsf6Q6NVF9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cpsf6Q6NVF9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cpsf6Q6NVF9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cpsf6Q6NVF9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cpsf6Q6NVF9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpsf6Q6NVF9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpsf6Q6NVF9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms