Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HelbQ6NVF4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HelbQ6NVF4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HelbQ6NVF4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HelbQ6NVF4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HelbQ6NVF4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HelbQ6NVF4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HelbQ6NVF4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HelbQ6NVF4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HelbQ6NVF4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HelbQ6NVF4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HelbQ6NVF4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HelbQ6NVF4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HelbQ6NVF4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HelbQ6NVF4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HelbQ6NVF4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HelbQ6NVF4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HelbQ6NVF4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HelbQ6NVF4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HelbQ6NVF4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HelbQ6NVF4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HelbQ6NVF4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HelbQ6NVF4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HelbQ6NVF4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HelbQ6NVF4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HelbQ6NVF4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HelbQ6NVF4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HelbQ6NVF4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HelbQ6NVF4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HelbQ6NVF4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HelbQ6NVF4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HelbQ6NVF4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HelbQ6NVF4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HelbQ6NVF4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HelbQ6NVF4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HelbQ6NVF4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HelbQ6NVF4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HelbQ6NVF4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HelbQ6NVF4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HelbQ6NVF4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HelbQ6NVF4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HelbQ6NVF4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HelbQ6NVF4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HelbQ6NVF4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HelbQ6NVF4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HelbQ6NVF4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HelbQ6NVF4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HelbQ6NVF4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HelbQ6NVF4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HelbQ6NVF4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HelbQ6NVF4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HelbQ6NVF4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HelbQ6NVF4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HelbQ6NVF4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HelbQ6NVF4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HelbQ6NVF4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HelbQ6NVF4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HelbQ6NVF4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HelbQ6NVF4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HelbQ6NVF4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HelbQ6NVF4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HelbQ6NVF4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HelbQ6NVF4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HelbQ6NVF4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HelbQ6NVF4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HelbQ6NVF4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HelbQ6NVF4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HelbQ6NVF4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HelbQ6NVF4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HelbQ6NVF4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HelbQ6NVF4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HelbQ6NVF4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HelbQ6NVF4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HelbQ6NVF4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HelbQ6NVF4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HelbQ6NVF4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HelbQ6NVF4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HelbQ6NVF4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HelbQ6NVF4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HelbQ6NVF4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HelbQ6NVF4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HelbQ6NVF4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HelbQ6NVF4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HelbQ6NVF4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HelbQ6NVF4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HelbQ6NVF4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HelbQ6NVF4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HelbQ6NVF4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HelbQ6NVF4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HelbQ6NVF4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HelbQ6NVF4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HelbQ6NVF4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HelbQ6NVF4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HelbQ6NVF4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HelbQ6NVF4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HelbQ6NVF4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HelbQ6NVF4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HelbQ6NVF4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HelbQ6NVF4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HelbQ6NVF4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms