Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV66

Zfp646, Zinc finger protein 646, mousemouse

Predictions only

Length 1,788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp646Q6NV66 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zfp646Q6NV66 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zfp646Q6NV66 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zfp646Q6NV66 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zfp646Q6NV66 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zfp646Q6NV66 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zfp646Q6NV66 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zfp646Q6NV66 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zfp646Q6NV66 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zfp646Q6NV66 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zfp646Q6NV66 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zfp646Q6NV66 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zfp646Q6NV66 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zfp646Q6NV66 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zfp646Q6NV66 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Zfp646Q6NV66 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zfp646Q6NV66 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zfp646Q6NV66 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zfp646Q6NV66 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zfp646Q6NV66 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zfp646Q6NV66 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Zfp646Q6NV66 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zfp646Q6NV66 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zfp646Q6NV66 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zfp646Q6NV66 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zfp646Q6NV66 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zfp646Q6NV66 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zfp646Q6NV66 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zfp646Q6NV66 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zfp646Q6NV66 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zfp646Q6NV66 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zfp646Q6NV66 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zfp646Q6NV66 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zfp646Q6NV66 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zfp646Q6NV66 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zfp646Q6NV66 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Zfp646Q6NV66 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Zfp646Q6NV66 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Zfp646Q6NV66 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zfp646Q6NV66 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zfp646Q6NV66 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zfp646Q6NV66 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zfp646Q6NV66 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zfp646Q6NV66 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zfp646Q6NV66 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zfp646Q6NV66 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zfp646Q6NV66 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zfp646Q6NV66 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zfp646Q6NV66 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zfp646Q6NV66 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zfp646Q6NV66 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zfp646Q6NV66 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Zfp646Q6NV66 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zfp646Q6NV66 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Zfp646Q6NV66 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zfp646Q6NV66 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zfp646Q6NV66 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zfp646Q6NV66 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zfp646Q6NV66 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zfp646Q6NV66 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zfp646Q6NV66 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zfp646Q6NV66 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zfp646Q6NV66 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zfp646Q6NV66 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zfp646Q6NV66 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zfp646Q6NV66 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zfp646Q6NV66 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zfp646Q6NV66 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zfp646Q6NV66 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zfp646Q6NV66 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zfp646Q6NV66 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zfp646Q6NV66 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zfp646Q6NV66 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zfp646Q6NV66 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Zfp646Q6NV66 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zfp646Q6NV66 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zfp646Q6NV66 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zfp646Q6NV66 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zfp646Q6NV66 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zfp646Q6NV66 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zfp646Q6NV66 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Zfp646Q6NV66 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Zfp646Q6NV66 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zfp646Q6NV66 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zfp646Q6NV66 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zfp646Q6NV66 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zfp646Q6NV66 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zfp646Q6NV66 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zfp646Q6NV66 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zfp646Q6NV66 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zfp646Q6NV66 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zfp646Q6NV66 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zfp646Q6NV66 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zfp646Q6NV66 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zfp646Q6NV66 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zfp646Q6NV66 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zfp646Q6NV66 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zfp646Q6NV66 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zfp646Q6NV66 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zfp646Q6NV66 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms