Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTA4

Rragb, Ras-related GTP-binding protein B, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RragbQ6NTA4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RragbQ6NTA4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RragbQ6NTA4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RragbQ6NTA4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RragbQ6NTA4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RragbQ6NTA4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RragbQ6NTA4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RragbQ6NTA4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RragbQ6NTA4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RragbQ6NTA4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RragbQ6NTA4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RragbQ6NTA4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RragbQ6NTA4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RragbQ6NTA4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RragbQ6NTA4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RragbQ6NTA4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RragbQ6NTA4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RragbQ6NTA4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RragbQ6NTA4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RragbQ6NTA4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RragbQ6NTA4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RragbQ6NTA4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RragbQ6NTA4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RragbQ6NTA4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RragbQ6NTA4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RragbQ6NTA4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RragbQ6NTA4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RragbQ6NTA4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RragbQ6NTA4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RragbQ6NTA4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RragbQ6NTA4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RragbQ6NTA4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RragbQ6NTA4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RragbQ6NTA4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RragbQ6NTA4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RragbQ6NTA4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RragbQ6NTA4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RragbQ6NTA4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RragbQ6NTA4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RragbQ6NTA4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RragbQ6NTA4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RragbQ6NTA4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RragbQ6NTA4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RragbQ6NTA4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RragbQ6NTA4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RragbQ6NTA4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RragbQ6NTA4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RragbQ6NTA4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RragbQ6NTA4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RragbQ6NTA4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RragbQ6NTA4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RragbQ6NTA4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RragbQ6NTA4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RragbQ6NTA4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RragbQ6NTA4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RragbQ6NTA4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RragbQ6NTA4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RragbQ6NTA4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RragbQ6NTA4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RragbQ6NTA4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RragbQ6NTA4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RragbQ6NTA4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RragbQ6NTA4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RragbQ6NTA4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RragbQ6NTA4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RragbQ6NTA4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RragbQ6NTA4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RragbQ6NTA4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RragbQ6NTA4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RragbQ6NTA4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RragbQ6NTA4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RragbQ6NTA4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RragbQ6NTA4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RragbQ6NTA4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RragbQ6NTA4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RragbQ6NTA4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RragbQ6NTA4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RragbQ6NTA4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RragbQ6NTA4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RragbQ6NTA4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RragbQ6NTA4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RragbQ6NTA4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RragbQ6NTA4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RragbQ6NTA4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RragbQ6NTA4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RragbQ6NTA4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RragbQ6NTA4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RragbQ6NTA4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RragbQ6NTA4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RragbQ6NTA4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RragbQ6NTA4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RragbQ6NTA4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RragbQ6NTA4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RragbQ6NTA4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RragbQ6NTA4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RragbQ6NTA4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RragbQ6NTA4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RragbQ6NTA4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RragbQ6NTA4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RragbQ6NTA4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms