Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSU2

2810408A11Rik, RIKEN cDNA 2810408A11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2810408A11RikQ6NSU2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms