Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Hecw2Q6I6G8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Hecw2Q6I6G8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Hecw2Q6I6G8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Hecw2Q6I6G8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Hecw2Q6I6G8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Hecw2Q6I6G8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Hecw2Q6I6G8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Hecw2Q6I6G8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Hecw2Q6I6G8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Hecw2Q6I6G8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Hecw2Q6I6G8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Hecw2Q6I6G8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Hecw2Q6I6G8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Hecw2Q6I6G8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Hecw2Q6I6G8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Hecw2Q6I6G8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Hecw2Q6I6G8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Hecw2Q6I6G8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Hecw2Q6I6G8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Hecw2Q6I6G8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Hecw2Q6I6G8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Hecw2Q6I6G8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Hecw2Q6I6G8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Hecw2Q6I6G8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Hecw2Q6I6G8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Hecw2Q6I6G8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Hecw2Q6I6G8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Hecw2Q6I6G8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Hecw2Q6I6G8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Hecw2Q6I6G8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Hecw2Q6I6G8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Hecw2Q6I6G8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Hecw2Q6I6G8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Hecw2Q6I6G8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Hecw2Q6I6G8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Hecw2Q6I6G8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Hecw2Q6I6G8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Hecw2Q6I6G8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Hecw2Q6I6G8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Hecw2Q6I6G8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Hecw2Q6I6G8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Hecw2Q6I6G8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Hecw2Q6I6G8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Hecw2Q6I6G8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Hecw2Q6I6G8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Hecw2Q6I6G8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Hecw2Q6I6G8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Hecw2Q6I6G8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Hecw2Q6I6G8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Hecw2Q6I6G8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Hecw2Q6I6G8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Hecw2Q6I6G8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Hecw2Q6I6G8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Hecw2Q6I6G8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Hecw2Q6I6G8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Hecw2Q6I6G8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Hecw2Q6I6G8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Hecw2Q6I6G8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
Hecw2Q6I6G8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Hecw2Q6I6G8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Hecw2Q6I6G8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Hecw2Q6I6G8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Hecw2Q6I6G8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Hecw2Q6I6G8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Hecw2Q6I6G8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Hecw2Q6I6G8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Hecw2Q6I6G8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Hecw2Q6I6G8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Hecw2Q6I6G8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Hecw2Q6I6G8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Hecw2Q6I6G8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Hecw2Q6I6G8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Hecw2Q6I6G8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Hecw2Q6I6G8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Hecw2Q6I6G8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Hecw2Q6I6G8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Hecw2Q6I6G8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Hecw2Q6I6G8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Hecw2Q6I6G8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Hecw2Q6I6G8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Hecw2Q6I6G8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Hecw2Q6I6G8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Hecw2Q6I6G8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Hecw2Q6I6G8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Hecw2Q6I6G8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Hecw2Q6I6G8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
Hecw2Q6I6G8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Hecw2Q6I6G8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Hecw2Q6I6G8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Hecw2Q6I6G8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Hecw2Q6I6G8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Hecw2Q6I6G8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Hecw2Q6I6G8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Hecw2Q6I6G8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Hecw2Q6I6G8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Hecw2Q6I6G8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Hecw2Q6I6G8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Hecw2Q6I6G8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Hecw2Q6I6G8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms