Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nop58Q6DFW4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nop58Q6DFW4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nop58Q6DFW4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nop58Q6DFW4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Nop58Q6DFW4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nop58Q6DFW4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nop58Q6DFW4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nop58Q6DFW4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nop58Q6DFW4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nop58Q6DFW4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nop58Q6DFW4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nop58Q6DFW4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nop58Q6DFW4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nop58Q6DFW4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nop58Q6DFW4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nop58Q6DFW4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nop58Q6DFW4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nop58Q6DFW4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nop58Q6DFW4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nop58Q6DFW4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Nop58Q6DFW4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Nop58Q6DFW4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nop58Q6DFW4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nop58Q6DFW4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nop58Q6DFW4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nop58Q6DFW4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nop58Q6DFW4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nop58Q6DFW4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nop58Q6DFW4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Nop58Q6DFW4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Nop58Q6DFW4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nop58Q6DFW4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nop58Q6DFW4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nop58Q6DFW4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nop58Q6DFW4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nop58Q6DFW4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nop58Q6DFW4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nop58Q6DFW4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nop58Q6DFW4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nop58Q6DFW4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nop58Q6DFW4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nop58Q6DFW4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nop58Q6DFW4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nop58Q6DFW4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nop58Q6DFW4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nop58Q6DFW4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nop58Q6DFW4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nop58Q6DFW4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nop58Q6DFW4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nop58Q6DFW4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nop58Q6DFW4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nop58Q6DFW4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Nop58Q6DFW4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nop58Q6DFW4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nop58Q6DFW4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nop58Q6DFW4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nop58Q6DFW4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nop58Q6DFW4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nop58Q6DFW4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nop58Q6DFW4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nop58Q6DFW4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nop58Q6DFW4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nop58Q6DFW4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nop58Q6DFW4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Nop58Q6DFW4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nop58Q6DFW4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nop58Q6DFW4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nop58Q6DFW4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nop58Q6DFW4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nop58Q6DFW4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nop58Q6DFW4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nop58Q6DFW4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Nop58Q6DFW4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nop58Q6DFW4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nop58Q6DFW4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nop58Q6DFW4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nop58Q6DFW4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nop58Q6DFW4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nop58Q6DFW4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nop58Q6DFW4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nop58Q6DFW4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Nop58Q6DFW4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nop58Q6DFW4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nop58Q6DFW4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nop58Q6DFW4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nop58Q6DFW4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nop58Q6DFW4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nop58Q6DFW4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nop58Q6DFW4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nop58Q6DFW4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nop58Q6DFW4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nop58Q6DFW4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nop58Q6DFW4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nop58Q6DFW4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nop58Q6DFW4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nop58Q6DFW4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nop58Q6DFW4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nop58Q6DFW4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nop58Q6DFW4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms