Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZU6

Thsd7a, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, mousemouse

Predictions only

Length 1,645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7aQ69ZU6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Thsd7aQ69ZU6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Thsd7aQ69ZU6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Thsd7aQ69ZU6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Thsd7aQ69ZU6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Thsd7aQ69ZU6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Thsd7aQ69ZU6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Thsd7aQ69ZU6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Thsd7aQ69ZU6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Thsd7aQ69ZU6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Thsd7aQ69ZU6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Thsd7aQ69ZU6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Thsd7aQ69ZU6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Thsd7aQ69ZU6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Thsd7aQ69ZU6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Thsd7aQ69ZU6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Thsd7aQ69ZU6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Thsd7aQ69ZU6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Thsd7aQ69ZU6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Thsd7aQ69ZU6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Thsd7aQ69ZU6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Thsd7aQ69ZU6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Thsd7aQ69ZU6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Thsd7aQ69ZU6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Thsd7aQ69ZU6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Thsd7aQ69ZU6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Thsd7aQ69ZU6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Thsd7aQ69ZU6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Thsd7aQ69ZU6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Thsd7aQ69ZU6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Thsd7aQ69ZU6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Thsd7aQ69ZU6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Thsd7aQ69ZU6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Thsd7aQ69ZU6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Thsd7aQ69ZU6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Thsd7aQ69ZU6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Thsd7aQ69ZU6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Thsd7aQ69ZU6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Thsd7aQ69ZU6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Thsd7aQ69ZU6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Thsd7aQ69ZU6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Thsd7aQ69ZU6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Thsd7aQ69ZU6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Thsd7aQ69ZU6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Thsd7aQ69ZU6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Thsd7aQ69ZU6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Thsd7aQ69ZU6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Thsd7aQ69ZU6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Thsd7aQ69ZU6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Thsd7aQ69ZU6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Thsd7aQ69ZU6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Thsd7aQ69ZU6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Thsd7aQ69ZU6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Thsd7aQ69ZU6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Thsd7aQ69ZU6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Thsd7aQ69ZU6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Thsd7aQ69ZU6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Thsd7aQ69ZU6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Thsd7aQ69ZU6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Thsd7aQ69ZU6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Thsd7aQ69ZU6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Thsd7aQ69ZU6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Thsd7aQ69ZU6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Thsd7aQ69ZU6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Thsd7aQ69ZU6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Thsd7aQ69ZU6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Thsd7aQ69ZU6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Thsd7aQ69ZU6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Thsd7aQ69ZU6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Thsd7aQ69ZU6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Thsd7aQ69ZU6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Thsd7aQ69ZU6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Thsd7aQ69ZU6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Thsd7aQ69ZU6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Thsd7aQ69ZU6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Thsd7aQ69ZU6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Thsd7aQ69ZU6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Thsd7aQ69ZU6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Thsd7aQ69ZU6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Thsd7aQ69ZU6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Thsd7aQ69ZU6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Thsd7aQ69ZU6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Thsd7aQ69ZU6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Thsd7aQ69ZU6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Thsd7aQ69ZU6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Thsd7aQ69ZU6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Thsd7aQ69ZU6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Thsd7aQ69ZU6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Thsd7aQ69ZU6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Thsd7aQ69ZU6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Thsd7aQ69ZU6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Thsd7aQ69ZU6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Thsd7aQ69ZU6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Thsd7aQ69ZU6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Thsd7aQ69ZU6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Thsd7aQ69ZU6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Thsd7aQ69ZU6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Thsd7aQ69ZU6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Thsd7aQ69ZU6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Thsd7aQ69ZU6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms