Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrcc1Q69ZB0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrcc1Q69ZB0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrcc1Q69ZB0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrcc1Q69ZB0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrcc1Q69ZB0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrcc1Q69ZB0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Lrrcc1Q69ZB0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Lrrcc1Q69ZB0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrcc1Q69ZB0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrcc1Q69ZB0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrcc1Q69ZB0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrcc1Q69ZB0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrcc1Q69ZB0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrcc1Q69ZB0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrcc1Q69ZB0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrcc1Q69ZB0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrcc1Q69ZB0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrcc1Q69ZB0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrcc1Q69ZB0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrcc1Q69ZB0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrcc1Q69ZB0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrcc1Q69ZB0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrcc1Q69ZB0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrcc1Q69ZB0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrcc1Q69ZB0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrcc1Q69ZB0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrcc1Q69ZB0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrcc1Q69ZB0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrcc1Q69ZB0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrcc1Q69ZB0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrcc1Q69ZB0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrcc1Q69ZB0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrcc1Q69ZB0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrcc1Q69ZB0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrcc1Q69ZB0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrcc1Q69ZB0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrcc1Q69ZB0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrcc1Q69ZB0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrcc1Q69ZB0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrcc1Q69ZB0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrcc1Q69ZB0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrcc1Q69ZB0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrcc1Q69ZB0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrcc1Q69ZB0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrcc1Q69ZB0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrcc1Q69ZB0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrcc1Q69ZB0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrcc1Q69ZB0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrcc1Q69ZB0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lrrcc1Q69ZB0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lrrcc1Q69ZB0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lrrcc1Q69ZB0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrcc1Q69ZB0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrcc1Q69ZB0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrcc1Q69ZB0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrcc1Q69ZB0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrcc1Q69ZB0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrcc1Q69ZB0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrcc1Q69ZB0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrcc1Q69ZB0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrcc1Q69ZB0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrcc1Q69ZB0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrcc1Q69ZB0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrcc1Q69ZB0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrcc1Q69ZB0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrcc1Q69ZB0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrcc1Q69ZB0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrcc1Q69ZB0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrcc1Q69ZB0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrcc1Q69ZB0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrcc1Q69ZB0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrcc1Q69ZB0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrcc1Q69ZB0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrcc1Q69ZB0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrcc1Q69ZB0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrcc1Q69ZB0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrcc1Q69ZB0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrcc1Q69ZB0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrcc1Q69ZB0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrcc1Q69ZB0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrcc1Q69ZB0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrcc1Q69ZB0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrcc1Q69ZB0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrcc1Q69ZB0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrcc1Q69ZB0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrcc1Q69ZB0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrcc1Q69ZB0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrcc1Q69ZB0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrcc1Q69ZB0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrcc1Q69ZB0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrcc1Q69ZB0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrcc1Q69ZB0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrcc1Q69ZB0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrcc1Q69ZB0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lrrcc1Q69ZB0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lrrcc1Q69ZB0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lrrcc1Q69ZB0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms