Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cntn4Q69Z26 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cntn4Q69Z26 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cntn4Q69Z26 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cntn4Q69Z26 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cntn4Q69Z26 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cntn4Q69Z26 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cntn4Q69Z26 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cntn4Q69Z26 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cntn4Q69Z26 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cntn4Q69Z26 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cntn4Q69Z26 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cntn4Q69Z26 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cntn4Q69Z26 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cntn4Q69Z26 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cntn4Q69Z26 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cntn4Q69Z26 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cntn4Q69Z26 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cntn4Q69Z26 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cntn4Q69Z26 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cntn4Q69Z26 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cntn4Q69Z26 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cntn4Q69Z26 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cntn4Q69Z26 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cntn4Q69Z26 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cntn4Q69Z26 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cntn4Q69Z26 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cntn4Q69Z26 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cntn4Q69Z26 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cntn4Q69Z26 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cntn4Q69Z26 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cntn4Q69Z26 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cntn4Q69Z26 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cntn4Q69Z26 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cntn4Q69Z26 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cntn4Q69Z26 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cntn4Q69Z26 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cntn4Q69Z26 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cntn4Q69Z26 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cntn4Q69Z26 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cntn4Q69Z26 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cntn4Q69Z26 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cntn4Q69Z26 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cntn4Q69Z26 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cntn4Q69Z26 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cntn4Q69Z26 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cntn4Q69Z26 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cntn4Q69Z26 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cntn4Q69Z26 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cntn4Q69Z26 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cntn4Q69Z26 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cntn4Q69Z26 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cntn4Q69Z26 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cntn4Q69Z26 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cntn4Q69Z26 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cntn4Q69Z26 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cntn4Q69Z26 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cntn4Q69Z26 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cntn4Q69Z26 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cntn4Q69Z26 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cntn4Q69Z26 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cntn4Q69Z26 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cntn4Q69Z26 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cntn4Q69Z26 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cntn4Q69Z26 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cntn4Q69Z26 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cntn4Q69Z26 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cntn4Q69Z26 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cntn4Q69Z26 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cntn4Q69Z26 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cntn4Q69Z26 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cntn4Q69Z26 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cntn4Q69Z26 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cntn4Q69Z26 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cntn4Q69Z26 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cntn4Q69Z26 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cntn4Q69Z26 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cntn4Q69Z26 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cntn4Q69Z26 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cntn4Q69Z26 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cntn4Q69Z26 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cntn4Q69Z26 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cntn4Q69Z26 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cntn4Q69Z26 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cntn4Q69Z26 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cntn4Q69Z26 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cntn4Q69Z26 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cntn4Q69Z26 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cntn4Q69Z26 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cntn4Q69Z26 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cntn4Q69Z26 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cntn4Q69Z26 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cntn4Q69Z26 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cntn4Q69Z26 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cntn4Q69Z26 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cntn4Q69Z26 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cntn4Q69Z26 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cntn4Q69Z26 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cntn4Q69Z26 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cntn4Q69Z26 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms