Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CilpQ66K08 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CilpQ66K08 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CilpQ66K08 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CilpQ66K08 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CilpQ66K08 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CilpQ66K08 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CilpQ66K08 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CilpQ66K08 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CilpQ66K08 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CilpQ66K08 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CilpQ66K08 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CilpQ66K08 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CilpQ66K08 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CilpQ66K08 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CilpQ66K08 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CilpQ66K08 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CilpQ66K08 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CilpQ66K08 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CilpQ66K08 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CilpQ66K08 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CilpQ66K08 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CilpQ66K08 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CilpQ66K08 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CilpQ66K08 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CilpQ66K08 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CilpQ66K08 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CilpQ66K08 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CilpQ66K08 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CilpQ66K08 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CilpQ66K08 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CilpQ66K08 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CilpQ66K08 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CilpQ66K08 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CilpQ66K08 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CilpQ66K08 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CilpQ66K08 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CilpQ66K08 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CilpQ66K08 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CilpQ66K08 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CilpQ66K08 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CilpQ66K08 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CilpQ66K08 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CilpQ66K08 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CilpQ66K08 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CilpQ66K08 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CilpQ66K08 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CilpQ66K08 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CilpQ66K08 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CilpQ66K08 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CilpQ66K08 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CilpQ66K08 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CilpQ66K08 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CilpQ66K08 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CilpQ66K08 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CilpQ66K08 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CilpQ66K08 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CilpQ66K08 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CilpQ66K08 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CilpQ66K08 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CilpQ66K08 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CilpQ66K08 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CilpQ66K08 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CilpQ66K08 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CilpQ66K08 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CilpQ66K08 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CilpQ66K08 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CilpQ66K08 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms