Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q66JV7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q66JV7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q66JV7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q66JV7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q66JV7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q66JV7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q66JV7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q66JV7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q66JV7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q66JV7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q66JV7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q66JV7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q66JV7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Q66JV7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q66JV7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q66JV7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q66JV7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q66JV7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q66JV7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q66JV7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q66JV7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q66JV7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q66JV7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q66JV7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q66JV7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q66JV7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q66JV7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q66JV7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q66JV7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q66JV7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q66JV7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q66JV7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q66JV7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q66JV7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q66JV7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q66JV7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q66JV7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q66JV7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q66JV7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q66JV7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q66JV7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q66JV7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q66JV7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q66JV7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q66JV7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q66JV7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q66JV7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q66JV7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q66JV7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Q66JV7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q66JV7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q66JV7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q66JV7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q66JV7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Q66JV7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q66JV7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q66JV7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q66JV7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q66JV7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q66JV7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q66JV7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q66JV7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q66JV7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q66JV7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q66JV7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q66JV7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q66JV7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q66JV7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q66JV7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q66JV7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q66JV7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q66JV7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Q66JV7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q66JV7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q66JV7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q66JV7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q66JV7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q66JV7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q66JV7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q66JV7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q66JV7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q66JV7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q66JV7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q66JV7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q66JV7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q66JV7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q66JV7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q66JV7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q66JV7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q66JV7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q66JV7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q66JV7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Q66JV7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q66JV7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q66JV7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q66JV7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q66JV7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q66JV7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Q66JV7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms