Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctnna3Q65CL1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctnna3Q65CL1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctnna3Q65CL1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctnna3Q65CL1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctnna3Q65CL1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctnna3Q65CL1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctnna3Q65CL1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ctnna3Q65CL1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ctnna3Q65CL1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ctnna3Q65CL1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ctnna3Q65CL1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctnna3Q65CL1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctnna3Q65CL1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctnna3Q65CL1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctnna3Q65CL1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctnna3Q65CL1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctnna3Q65CL1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctnna3Q65CL1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctnna3Q65CL1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctnna3Q65CL1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctnna3Q65CL1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctnna3Q65CL1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctnna3Q65CL1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctnna3Q65CL1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctnna3Q65CL1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctnna3Q65CL1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctnna3Q65CL1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctnna3Q65CL1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctnna3Q65CL1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctnna3Q65CL1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctnna3Q65CL1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctnna3Q65CL1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctnna3Q65CL1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctnna3Q65CL1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctnna3Q65CL1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctnna3Q65CL1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctnna3Q65CL1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctnna3Q65CL1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctnna3Q65CL1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctnna3Q65CL1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctnna3Q65CL1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctnna3Q65CL1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctnna3Q65CL1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctnna3Q65CL1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctnna3Q65CL1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctnna3Q65CL1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctnna3Q65CL1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctnna3Q65CL1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctnna3Q65CL1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctnna3Q65CL1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctnna3Q65CL1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctnna3Q65CL1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctnna3Q65CL1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctnna3Q65CL1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctnna3Q65CL1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctnna3Q65CL1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctnna3Q65CL1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctnna3Q65CL1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctnna3Q65CL1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctnna3Q65CL1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctnna3Q65CL1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctnna3Q65CL1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctnna3Q65CL1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ctnna3Q65CL1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ctnna3Q65CL1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctnna3Q65CL1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctnna3Q65CL1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctnna3Q65CL1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctnna3Q65CL1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctnna3Q65CL1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctnna3Q65CL1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctnna3Q65CL1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctnna3Q65CL1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctnna3Q65CL1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctnna3Q65CL1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctnna3Q65CL1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctnna3Q65CL1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctnna3Q65CL1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctnna3Q65CL1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctnna3Q65CL1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctnna3Q65CL1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctnna3Q65CL1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctnna3Q65CL1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctnna3Q65CL1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctnna3Q65CL1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctnna3Q65CL1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctnna3Q65CL1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctnna3Q65CL1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctnna3Q65CL1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctnna3Q65CL1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctnna3Q65CL1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctnna3Q65CL1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctnna3Q65CL1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctnna3Q65CL1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctnna3Q65CL1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctnna3Q65CL1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctnna3Q65CL1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctnna3Q65CL1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctnna3Q65CL1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms