Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Surf4Q64310 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Surf4Q64310 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Surf4Q64310 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Surf4Q64310 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Surf4Q64310 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Surf4Q64310 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Surf4Q64310 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Surf4Q64310 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Surf4Q64310 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Surf4Q64310 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Surf4Q64310 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Surf4Q64310 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Surf4Q64310 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Surf4Q64310 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Surf4Q64310 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Surf4Q64310 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Surf4Q64310 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Surf4Q64310 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Surf4Q64310 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Surf4Q64310 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Surf4Q64310 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Surf4Q64310 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Surf4Q64310 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Surf4Q64310 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Surf4Q64310 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Surf4Q64310 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Surf4Q64310 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Surf4Q64310 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Surf4Q64310 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Surf4Q64310 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Surf4Q64310 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Surf4Q64310 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Surf4Q64310 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Surf4Q64310 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Surf4Q64310 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Surf4Q64310 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Surf4Q64310 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Surf4Q64310 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Surf4Q64310 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Surf4Q64310 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Surf4Q64310 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Surf4Q64310 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Surf4Q64310 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Surf4Q64310 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Surf4Q64310 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Surf4Q64310 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Surf4Q64310 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Surf4Q64310 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Surf4Q64310 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Surf4Q64310 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Surf4Q64310 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Surf4Q64310 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Surf4Q64310 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Surf4Q64310 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Surf4Q64310 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms