Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Krt12Q64291 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Krt12Q64291 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt12Q64291 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt12Q64291 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt12Q64291 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt12Q64291 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt12Q64291 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt12Q64291 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt12Q64291 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt12Q64291 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt12Q64291 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt12Q64291 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt12Q64291 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt12Q64291 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt12Q64291 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt12Q64291 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt12Q64291 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt12Q64291 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt12Q64291 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt12Q64291 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt12Q64291 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt12Q64291 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt12Q64291 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt12Q64291 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt12Q64291 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt12Q64291 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt12Q64291 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt12Q64291 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt12Q64291 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt12Q64291 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt12Q64291 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt12Q64291 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt12Q64291 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt12Q64291 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt12Q64291 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt12Q64291 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt12Q64291 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt12Q64291 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt12Q64291 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt12Q64291 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt12Q64291 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt12Q64291 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt12Q64291 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt12Q64291 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt12Q64291 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt12Q64291 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Krt12Q64291 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt12Q64291 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt12Q64291 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt12Q64291 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt12Q64291 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt12Q64291 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt12Q64291 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt12Q64291 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt12Q64291 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt12Q64291 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt12Q64291 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt12Q64291 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt12Q64291 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt12Q64291 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt12Q64291 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt12Q64291 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt12Q64291 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt12Q64291 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt12Q64291 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt12Q64291 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt12Q64291 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt12Q64291 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt12Q64291 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt12Q64291 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt12Q64291 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt12Q64291 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt12Q64291 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt12Q64291 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt12Q64291 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt12Q64291 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt12Q64291 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt12Q64291 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt12Q64291 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt12Q64291 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt12Q64291 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt12Q64291 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt12Q64291 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt12Q64291 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt12Q64291 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt12Q64291 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt12Q64291 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt12Q64291 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt12Q64291 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt12Q64291 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt12Q64291 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt12Q64291 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt12Q64291 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt12Q64291 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt12Q64291 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt12Q64291 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt12Q64291 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt12Q64291 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Krt12Q64291 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms