Protein–RNA interactions for Protein: Q62461

Gm20854, (clone BALB10N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20854Q62461 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20854Q62461 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20854Q62461 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20854Q62461 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20854Q62461 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20854Q62461 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20854Q62461 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20854Q62461 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms