Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sp4Q62445 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sp4Q62445 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sp4Q62445 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sp4Q62445 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sp4Q62445 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sp4Q62445 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sp4Q62445 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sp4Q62445 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sp4Q62445 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sp4Q62445 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Sp4Q62445 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sp4Q62445 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sp4Q62445 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sp4Q62445 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sp4Q62445 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sp4Q62445 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sp4Q62445 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sp4Q62445 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sp4Q62445 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sp4Q62445 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sp4Q62445 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Sp4Q62445 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sp4Q62445 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sp4Q62445 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sp4Q62445 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sp4Q62445 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sp4Q62445 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Sp4Q62445 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sp4Q62445 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sp4Q62445 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sp4Q62445 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sp4Q62445 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sp4Q62445 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sp4Q62445 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sp4Q62445 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sp4Q62445 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sp4Q62445 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sp4Q62445 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sp4Q62445 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sp4Q62445 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Sp4Q62445 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sp4Q62445 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sp4Q62445 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sp4Q62445 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sp4Q62445 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sp4Q62445 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Sp4Q62445 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sp4Q62445 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sp4Q62445 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sp4Q62445 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sp4Q62445 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sp4Q62445 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sp4Q62445 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sp4Q62445 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sp4Q62445 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sp4Q62445 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sp4Q62445 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sp4Q62445 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sp4Q62445 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sp4Q62445 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Sp4Q62445 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sp4Q62445 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sp4Q62445 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sp4Q62445 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sp4Q62445 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sp4Q62445 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sp4Q62445 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sp4Q62445 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sp4Q62445 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sp4Q62445 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sp4Q62445 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sp4Q62445 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sp4Q62445 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sp4Q62445 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sp4Q62445 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sp4Q62445 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sp4Q62445 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sp4Q62445 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sp4Q62445 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sp4Q62445 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sp4Q62445 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sp4Q62445 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sp4Q62445 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sp4Q62445 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sp4Q62445 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sp4Q62445 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sp4Q62445 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sp4Q62445 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sp4Q62445 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sp4Q62445 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sp4Q62445 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sp4Q62445 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Sp4Q62445 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sp4Q62445 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sp4Q62445 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sp4Q62445 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sp4Q62445 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sp4Q62445 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sp4Q62445 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms