Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxa13Q62424 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxa13Q62424 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxa13Q62424 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxa13Q62424 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxa13Q62424 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxa13Q62424 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxa13Q62424 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxa13Q62424 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxa13Q62424 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxa13Q62424 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxa13Q62424 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxa13Q62424 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxa13Q62424 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxa13Q62424 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxa13Q62424 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxa13Q62424 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxa13Q62424 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxa13Q62424 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxa13Q62424 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxa13Q62424 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxa13Q62424 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxa13Q62424 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxa13Q62424 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxa13Q62424 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxa13Q62424 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxa13Q62424 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxa13Q62424 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxa13Q62424 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxa13Q62424 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxa13Q62424 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxa13Q62424 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxa13Q62424 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxa13Q62424 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxa13Q62424 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxa13Q62424 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxa13Q62424 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxa13Q62424 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxa13Q62424 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxa13Q62424 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxa13Q62424 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxa13Q62424 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxa13Q62424 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxa13Q62424 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxa13Q62424 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxa13Q62424 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxa13Q62424 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxa13Q62424 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxa13Q62424 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxa13Q62424 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxa13Q62424 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxa13Q62424 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hoxa13Q62424 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxa13Q62424 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxa13Q62424 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxa13Q62424 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxa13Q62424 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxa13Q62424 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxa13Q62424 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxa13Q62424 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxa13Q62424 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxa13Q62424 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxa13Q62424 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxa13Q62424 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxa13Q62424 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxa13Q62424 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxa13Q62424 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxa13Q62424 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxa13Q62424 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxa13Q62424 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxa13Q62424 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxa13Q62424 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxa13Q62424 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxa13Q62424 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxa13Q62424 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxa13Q62424 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxa13Q62424 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxa13Q62424 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxa13Q62424 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxa13Q62424 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxa13Q62424 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxa13Q62424 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxa13Q62424 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxa13Q62424 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxa13Q62424 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxa13Q62424 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxa13Q62424 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxa13Q62424 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxa13Q62424 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxa13Q62424 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxa13Q62424 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxa13Q62424 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxa13Q62424 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxa13Q62424 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxa13Q62424 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxa13Q62424 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxa13Q62424 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxa13Q62424 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxa13Q62424 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxa13Q62424 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
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