Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tff3Q62395 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms