Protein–RNA interactions for Protein: Q62348

Tsn, Translin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsnQ62348 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TsnQ62348 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TsnQ62348 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TsnQ62348 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TsnQ62348 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TsnQ62348 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TsnQ62348 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TsnQ62348 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TsnQ62348 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TsnQ62348 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TsnQ62348 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TsnQ62348 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TsnQ62348 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TsnQ62348 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
TsnQ62348 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TsnQ62348 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TsnQ62348 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TsnQ62348 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TsnQ62348 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TsnQ62348 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TsnQ62348 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TsnQ62348 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TsnQ62348 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TsnQ62348 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TsnQ62348 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TsnQ62348 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TsnQ62348 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TsnQ62348 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TsnQ62348 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TsnQ62348 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TsnQ62348 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TsnQ62348 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TsnQ62348 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TsnQ62348 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TsnQ62348 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TsnQ62348 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TsnQ62348 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TsnQ62348 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TsnQ62348 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TsnQ62348 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TsnQ62348 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TsnQ62348 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TsnQ62348 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TsnQ62348 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TsnQ62348 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TsnQ62348 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TsnQ62348 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TsnQ62348 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TsnQ62348 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TsnQ62348 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TsnQ62348 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TsnQ62348 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TsnQ62348 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TsnQ62348 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TsnQ62348 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TsnQ62348 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TsnQ62348 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TsnQ62348 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TsnQ62348 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TsnQ62348 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TsnQ62348 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TsnQ62348 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TsnQ62348 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TsnQ62348 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TsnQ62348 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TsnQ62348 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TsnQ62348 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TsnQ62348 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TsnQ62348 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TsnQ62348 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TsnQ62348 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TsnQ62348 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TsnQ62348 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TsnQ62348 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TsnQ62348 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TsnQ62348 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TsnQ62348 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TsnQ62348 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TsnQ62348 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TsnQ62348 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TsnQ62348 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TsnQ62348 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TsnQ62348 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TsnQ62348 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TsnQ62348 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TsnQ62348 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TsnQ62348 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TsnQ62348 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TsnQ62348 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TsnQ62348 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TsnQ62348 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TsnQ62348 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TsnQ62348 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TsnQ62348 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TsnQ62348 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TsnQ62348 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TsnQ62348 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TsnQ62348 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TsnQ62348 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TsnQ62348 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms