Protein–RNA interactions for Protein: Q62288

Spock1, Testican-1, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock1Q62288 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spock1Q62288 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spock1Q62288 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spock1Q62288 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spock1Q62288 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spock1Q62288 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spock1Q62288 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spock1Q62288 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spock1Q62288 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spock1Q62288 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spock1Q62288 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spock1Q62288 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spock1Q62288 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spock1Q62288 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spock1Q62288 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spock1Q62288 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spock1Q62288 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spock1Q62288 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spock1Q62288 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spock1Q62288 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spock1Q62288 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spock1Q62288 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spock1Q62288 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spock1Q62288 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spock1Q62288 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spock1Q62288 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spock1Q62288 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spock1Q62288 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spock1Q62288 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spock1Q62288 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spock1Q62288 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spock1Q62288 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spock1Q62288 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spock1Q62288 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spock1Q62288 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spock1Q62288 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spock1Q62288 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spock1Q62288 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spock1Q62288 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spock1Q62288 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spock1Q62288 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spock1Q62288 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spock1Q62288 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spock1Q62288 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spock1Q62288 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spock1Q62288 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spock1Q62288 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spock1Q62288 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spock1Q62288 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spock1Q62288 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms