Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Sall3Q62255 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Sall3Q62255 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Sall3Q62255 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Sall3Q62255 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Sall3Q62255 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sall3Q62255 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sall3Q62255 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sall3Q62255 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sall3Q62255 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sall3Q62255 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sall3Q62255 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sall3Q62255 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Sall3Q62255 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Sall3Q62255 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Sall3Q62255 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Sall3Q62255 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Sall3Q62255 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Sall3Q62255 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Sall3Q62255 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Sall3Q62255 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Sall3Q62255 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sall3Q62255 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sall3Q62255 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sall3Q62255 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Sall3Q62255 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sall3Q62255 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sall3Q62255 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sall3Q62255 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sall3Q62255 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sall3Q62255 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Sall3Q62255 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Sall3Q62255 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Sall3Q62255 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Sall3Q62255 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Sall3Q62255 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Sall3Q62255 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Sall3Q62255 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Sall3Q62255 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Sall3Q62255 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Sall3Q62255 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Sall3Q62255 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Sall3Q62255 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Sall3Q62255 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Sall3Q62255 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Sall3Q62255 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Sall3Q62255 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Sall3Q62255 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sall3Q62255 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sall3Q62255 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sall3Q62255 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sall3Q62255 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sall3Q62255 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sall3Q62255 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sall3Q62255 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sall3Q62255 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sall3Q62255 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sall3Q62255 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Sall3Q62255 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sall3Q62255 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sall3Q62255 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sall3Q62255 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sall3Q62255 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sall3Q62255 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sall3Q62255 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Sall3Q62255 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Sall3Q62255 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Sall3Q62255 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sall3Q62255 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sall3Q62255 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sall3Q62255 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Sall3Q62255 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Sall3Q62255 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Sall3Q62255 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Sall3Q62255 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Sall3Q62255 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Sall3Q62255 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Sall3Q62255 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Sall3Q62255 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Sall3Q62255 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Sall3Q62255 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Sall3Q62255 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Sall3Q62255 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Sall3Q62255 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Sall3Q62255 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Sall3Q62255 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Sall3Q62255 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Sall3Q62255 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Sall3Q62255 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Sall3Q62255 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Sall3Q62255 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Sall3Q62255 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Sall3Q62255 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Sall3Q62255 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Sall3Q62255 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Sall3Q62255 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Sall3Q62255 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Sall3Q62255 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Sall3Q62255 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sall3Q62255 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms