Protein–RNA interactions for Protein: Q62168

Krt32, Keratin, type I cuticular Ha2, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt32Q62168 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt32Q62168 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt32Q62168 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt32Q62168 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt32Q62168 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt32Q62168 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt32Q62168 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt32Q62168 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt32Q62168 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt32Q62168 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt32Q62168 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt32Q62168 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt32Q62168 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt32Q62168 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt32Q62168 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt32Q62168 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt32Q62168 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt32Q62168 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt32Q62168 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt32Q62168 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt32Q62168 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt32Q62168 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt32Q62168 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt32Q62168 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt32Q62168 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt32Q62168 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt32Q62168 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt32Q62168 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt32Q62168 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt32Q62168 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt32Q62168 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt32Q62168 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt32Q62168 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt32Q62168 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt32Q62168 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt32Q62168 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt32Q62168 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms