Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Phox2aQ62066 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phox2aQ62066 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phox2aQ62066 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Phox2aQ62066 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phox2aQ62066 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phox2aQ62066 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phox2aQ62066 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Phox2aQ62066 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Phox2aQ62066 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phox2aQ62066 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phox2aQ62066 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phox2aQ62066 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms