Protein–RNA interactions for Protein: Q61817

Creb3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3Q61817 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Creb3Q61817 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Creb3Q61817 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Creb3Q61817 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Creb3Q61817 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Creb3Q61817 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Creb3Q61817 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Creb3Q61817 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Creb3Q61817 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Creb3Q61817 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Creb3Q61817 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Creb3Q61817 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Creb3Q61817 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Creb3Q61817 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Creb3Q61817 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Creb3Q61817 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Creb3Q61817 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Creb3Q61817 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Creb3Q61817 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Creb3Q61817 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Creb3Q61817 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Creb3Q61817 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Creb3Q61817 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Creb3Q61817 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Creb3Q61817 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Creb3Q61817 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Creb3Q61817 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Creb3Q61817 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Creb3Q61817 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Creb3Q61817 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Creb3Q61817 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Creb3Q61817 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Creb3Q61817 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Creb3Q61817 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Creb3Q61817 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Creb3Q61817 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Creb3Q61817 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Creb3Q61817 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Creb3Q61817 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Creb3Q61817 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Creb3Q61817 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Creb3Q61817 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Creb3Q61817 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Creb3Q61817 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Creb3Q61817 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Creb3Q61817 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Creb3Q61817 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Creb3Q61817 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Creb3Q61817 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Creb3Q61817 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Creb3Q61817 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Creb3Q61817 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Creb3Q61817 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Creb3Q61817 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Creb3Q61817 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Creb3Q61817 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Creb3Q61817 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Creb3Q61817 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Creb3Q61817 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Creb3Q61817 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Creb3Q61817 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Creb3Q61817 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Creb3Q61817 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Creb3Q61817 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Creb3Q61817 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Creb3Q61817 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Creb3Q61817 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Creb3Q61817 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Creb3Q61817 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Creb3Q61817 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Creb3Q61817 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Creb3Q61817 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Creb3Q61817 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Creb3Q61817 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Creb3Q61817 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Creb3Q61817 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Creb3Q61817 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Creb3Q61817 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Creb3Q61817 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Creb3Q61817 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Creb3Q61817 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Creb3Q61817 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Creb3Q61817 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Creb3Q61817 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Creb3Q61817 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Creb3Q61817 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Creb3Q61817 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Creb3Q61817 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Creb3Q61817 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Creb3Q61817 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.27■■□□□ 1
Creb3Q61817 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Creb3Q61817 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Creb3Q61817 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Creb3Q61817 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Creb3Q61817 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Creb3Q61817 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Creb3Q61817 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Creb3Q61817 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Creb3Q61817 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Creb3Q61817 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms