Protein–RNA interactions for Protein: Q61789

Lama3, Laminin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 3,330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama3Q61789 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lama3Q61789 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lama3Q61789 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lama3Q61789 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lama3Q61789 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lama3Q61789 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lama3Q61789 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lama3Q61789 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lama3Q61789 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Lama3Q61789 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lama3Q61789 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lama3Q61789 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lama3Q61789 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lama3Q61789 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lama3Q61789 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lama3Q61789 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lama3Q61789 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lama3Q61789 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lama3Q61789 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lama3Q61789 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lama3Q61789 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lama3Q61789 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lama3Q61789 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lama3Q61789 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lama3Q61789 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lama3Q61789 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lama3Q61789 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lama3Q61789 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lama3Q61789 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lama3Q61789 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lama3Q61789 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lama3Q61789 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lama3Q61789 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lama3Q61789 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lama3Q61789 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lama3Q61789 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lama3Q61789 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lama3Q61789 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lama3Q61789 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lama3Q61789 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Lama3Q61789 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lama3Q61789 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lama3Q61789 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lama3Q61789 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lama3Q61789 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lama3Q61789 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lama3Q61789 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lama3Q61789 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Lama3Q61789 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lama3Q61789 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lama3Q61789 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lama3Q61789 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lama3Q61789 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lama3Q61789 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lama3Q61789 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Lama3Q61789 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lama3Q61789 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lama3Q61789 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Lama3Q61789 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lama3Q61789 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lama3Q61789 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lama3Q61789 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lama3Q61789 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lama3Q61789 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lama3Q61789 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lama3Q61789 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lama3Q61789 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lama3Q61789 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lama3Q61789 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lama3Q61789 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lama3Q61789 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lama3Q61789 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lama3Q61789 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lama3Q61789 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lama3Q61789 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lama3Q61789 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lama3Q61789 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lama3Q61789 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lama3Q61789 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lama3Q61789 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lama3Q61789 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lama3Q61789 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lama3Q61789 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lama3Q61789 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lama3Q61789 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lama3Q61789 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lama3Q61789 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lama3Q61789 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lama3Q61789 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lama3Q61789 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lama3Q61789 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lama3Q61789 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lama3Q61789 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lama3Q61789 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lama3Q61789 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lama3Q61789 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lama3Q61789 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lama3Q61789 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lama3Q61789 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lama3Q61789 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms