Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Gli3Q61602 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Gli3Q61602 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Gli3Q61602 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Gli3Q61602 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Gli3Q61602 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gli3Q61602 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gli3Q61602 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gli3Q61602 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gli3Q61602 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gli3Q61602 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gli3Q61602 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gli3Q61602 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gli3Q61602 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gli3Q61602 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gli3Q61602 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gli3Q61602 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gli3Q61602 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Gli3Q61602 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gli3Q61602 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gli3Q61602 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gli3Q61602 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Gli3Q61602 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gli3Q61602 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gli3Q61602 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Gli3Q61602 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gli3Q61602 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gli3Q61602 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gli3Q61602 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gli3Q61602 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gli3Q61602 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Gli3Q61602 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Gli3Q61602 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gli3Q61602 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gli3Q61602 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gli3Q61602 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gli3Q61602 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gli3Q61602 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gli3Q61602 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Gli3Q61602 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gli3Q61602 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gli3Q61602 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gli3Q61602 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gli3Q61602 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gli3Q61602 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Gli3Q61602 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gli3Q61602 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gli3Q61602 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gli3Q61602 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gli3Q61602 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gli3Q61602 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Gli3Q61602 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gli3Q61602 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Gli3Q61602 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gli3Q61602 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gli3Q61602 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gli3Q61602 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gli3Q61602 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Gli3Q61602 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gli3Q61602 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gli3Q61602 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gli3Q61602 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gli3Q61602 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gli3Q61602 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gli3Q61602 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gli3Q61602 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gli3Q61602 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gli3Q61602 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gli3Q61602 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gli3Q61602 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gli3Q61602 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gli3Q61602 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gli3Q61602 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Gli3Q61602 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gli3Q61602 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Gli3Q61602 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gli3Q61602 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gli3Q61602 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Gli3Q61602 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gli3Q61602 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gli3Q61602 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gli3Q61602 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gli3Q61602 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gli3Q61602 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gli3Q61602 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gli3Q61602 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gli3Q61602 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gli3Q61602 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Gli3Q61602 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Gli3Q61602 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Gli3Q61602 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Gli3Q61602 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gli3Q61602 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gli3Q61602 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gli3Q61602 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gli3Q61602 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gli3Q61602 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gli3Q61602 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gli3Q61602 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gli3Q61602 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms