Protein–RNA interactions for Protein: Q61553

Fscn1, Fascin, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fscn1Q61553 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fscn1Q61553 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fscn1Q61553 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Fscn1Q61553 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fscn1Q61553 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fscn1Q61553 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fscn1Q61553 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fscn1Q61553 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Fscn1Q61553 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fscn1Q61553 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fscn1Q61553 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fscn1Q61553 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fscn1Q61553 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fscn1Q61553 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fscn1Q61553 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fscn1Q61553 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fscn1Q61553 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fscn1Q61553 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fscn1Q61553 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Fscn1Q61553 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fscn1Q61553 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fscn1Q61553 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fscn1Q61553 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fscn1Q61553 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fscn1Q61553 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fscn1Q61553 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fscn1Q61553 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fscn1Q61553 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fscn1Q61553 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fscn1Q61553 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fscn1Q61553 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fscn1Q61553 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fscn1Q61553 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fscn1Q61553 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fscn1Q61553 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fscn1Q61553 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fscn1Q61553 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Fscn1Q61553 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fscn1Q61553 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fscn1Q61553 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fscn1Q61553 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fscn1Q61553 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fscn1Q61553 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Fscn1Q61553 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Fscn1Q61553 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fscn1Q61553 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fscn1Q61553 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fscn1Q61553 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fscn1Q61553 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Fscn1Q61553 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Fscn1Q61553 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Fscn1Q61553 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Fscn1Q61553 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fscn1Q61553 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fscn1Q61553 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Fscn1Q61553 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fscn1Q61553 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fscn1Q61553 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fscn1Q61553 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fscn1Q61553 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fscn1Q61553 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fscn1Q61553 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fscn1Q61553 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fscn1Q61553 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Fscn1Q61553 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fscn1Q61553 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Fscn1Q61553 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fscn1Q61553 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fscn1Q61553 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fscn1Q61553 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fscn1Q61553 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fscn1Q61553 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fscn1Q61553 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fscn1Q61553 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fscn1Q61553 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fscn1Q61553 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fscn1Q61553 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fscn1Q61553 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Fscn1Q61553 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fscn1Q61553 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fscn1Q61553 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fscn1Q61553 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fscn1Q61553 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fscn1Q61553 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fscn1Q61553 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fscn1Q61553 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fscn1Q61553 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fscn1Q61553 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Fscn1Q61553 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fscn1Q61553 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fscn1Q61553 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fscn1Q61553 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fscn1Q61553 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fscn1Q61553 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fscn1Q61553 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fscn1Q61553 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fscn1Q61553 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fscn1Q61553 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fscn1Q61553 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fscn1Q61553 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms