Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pde3bQ61409 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pde3bQ61409 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pde3bQ61409 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Pde3bQ61409 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pde3bQ61409 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pde3bQ61409 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pde3bQ61409 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pde3bQ61409 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pde3bQ61409 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pde3bQ61409 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pde3bQ61409 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pde3bQ61409 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Pde3bQ61409 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pde3bQ61409 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pde3bQ61409 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pde3bQ61409 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pde3bQ61409 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pde3bQ61409 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pde3bQ61409 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Pde3bQ61409 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pde3bQ61409 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pde3bQ61409 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pde3bQ61409 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pde3bQ61409 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pde3bQ61409 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pde3bQ61409 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pde3bQ61409 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pde3bQ61409 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pde3bQ61409 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pde3bQ61409 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pde3bQ61409 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pde3bQ61409 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Pde3bQ61409 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pde3bQ61409 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pde3bQ61409 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde3bQ61409 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde3bQ61409 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde3bQ61409 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde3bQ61409 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pde3bQ61409 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Pde3bQ61409 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Pde3bQ61409 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pde3bQ61409 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pde3bQ61409 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pde3bQ61409 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pde3bQ61409 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pde3bQ61409 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pde3bQ61409 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pde3bQ61409 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Pde3bQ61409 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pde3bQ61409 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pde3bQ61409 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pde3bQ61409 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pde3bQ61409 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pde3bQ61409 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pde3bQ61409 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pde3bQ61409 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pde3bQ61409 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pde3bQ61409 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pde3bQ61409 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pde3bQ61409 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pde3bQ61409 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Pde3bQ61409 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pde3bQ61409 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pde3bQ61409 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pde3bQ61409 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pde3bQ61409 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Pde3bQ61409 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pde3bQ61409 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pde3bQ61409 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pde3bQ61409 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pde3bQ61409 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pde3bQ61409 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pde3bQ61409 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pde3bQ61409 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pde3bQ61409 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pde3bQ61409 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pde3bQ61409 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pde3bQ61409 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pde3bQ61409 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pde3bQ61409 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pde3bQ61409 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pde3bQ61409 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pde3bQ61409 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pde3bQ61409 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Pde3bQ61409 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pde3bQ61409 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pde3bQ61409 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pde3bQ61409 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Pde3bQ61409 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Pde3bQ61409 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Pde3bQ61409 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pde3bQ61409 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pde3bQ61409 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Pde3bQ61409 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pde3bQ61409 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Pde3bQ61409 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pde3bQ61409 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pde3bQ61409 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms