Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BcanQ61361 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BcanQ61361 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BcanQ61361 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BcanQ61361 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BcanQ61361 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BcanQ61361 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BcanQ61361 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BcanQ61361 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BcanQ61361 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BcanQ61361 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
BcanQ61361 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BcanQ61361 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BcanQ61361 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BcanQ61361 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BcanQ61361 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
BcanQ61361 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BcanQ61361 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BcanQ61361 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BcanQ61361 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BcanQ61361 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BcanQ61361 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BcanQ61361 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BcanQ61361 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BcanQ61361 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BcanQ61361 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BcanQ61361 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BcanQ61361 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BcanQ61361 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
BcanQ61361 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
BcanQ61361 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BcanQ61361 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BcanQ61361 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BcanQ61361 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BcanQ61361 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BcanQ61361 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BcanQ61361 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BcanQ61361 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BcanQ61361 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BcanQ61361 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BcanQ61361 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BcanQ61361 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BcanQ61361 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BcanQ61361 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BcanQ61361 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BcanQ61361 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BcanQ61361 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BcanQ61361 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BcanQ61361 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BcanQ61361 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BcanQ61361 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BcanQ61361 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BcanQ61361 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BcanQ61361 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BcanQ61361 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BcanQ61361 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BcanQ61361 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BcanQ61361 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BcanQ61361 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BcanQ61361 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BcanQ61361 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BcanQ61361 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BcanQ61361 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BcanQ61361 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BcanQ61361 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BcanQ61361 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BcanQ61361 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BcanQ61361 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BcanQ61361 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BcanQ61361 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BcanQ61361 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BcanQ61361 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BcanQ61361 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BcanQ61361 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BcanQ61361 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BcanQ61361 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BcanQ61361 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BcanQ61361 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BcanQ61361 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
BcanQ61361 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BcanQ61361 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BcanQ61361 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BcanQ61361 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BcanQ61361 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BcanQ61361 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BcanQ61361 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BcanQ61361 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BcanQ61361 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BcanQ61361 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BcanQ61361 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BcanQ61361 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BcanQ61361 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BcanQ61361 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BcanQ61361 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BcanQ61361 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BcanQ61361 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BcanQ61361 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BcanQ61361 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BcanQ61361 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BcanQ61361 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
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