Protein–RNA interactions for Protein: Q61205

Pafah1b3, Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit gamma, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pafah1b3Q61205 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pafah1b3Q61205 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pafah1b3Q61205 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pafah1b3Q61205 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pafah1b3Q61205 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pafah1b3Q61205 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pafah1b3Q61205 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pafah1b3Q61205 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pafah1b3Q61205 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pafah1b3Q61205 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pafah1b3Q61205 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pafah1b3Q61205 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pafah1b3Q61205 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pafah1b3Q61205 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pafah1b3Q61205 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pafah1b3Q61205 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pafah1b3Q61205 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pafah1b3Q61205 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pafah1b3Q61205 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pafah1b3Q61205 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pafah1b3Q61205 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pafah1b3Q61205 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pafah1b3Q61205 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pafah1b3Q61205 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pafah1b3Q61205 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pafah1b3Q61205 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pafah1b3Q61205 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pafah1b3Q61205 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pafah1b3Q61205 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pafah1b3Q61205 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pafah1b3Q61205 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pafah1b3Q61205 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pafah1b3Q61205 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pafah1b3Q61205 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pafah1b3Q61205 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pafah1b3Q61205 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pafah1b3Q61205 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pafah1b3Q61205 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pafah1b3Q61205 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pafah1b3Q61205 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pafah1b3Q61205 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pafah1b3Q61205 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pafah1b3Q61205 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pafah1b3Q61205 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pafah1b3Q61205 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pafah1b3Q61205 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pafah1b3Q61205 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pafah1b3Q61205 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pafah1b3Q61205 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pafah1b3Q61205 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pafah1b3Q61205 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pafah1b3Q61205 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pafah1b3Q61205 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pafah1b3Q61205 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pafah1b3Q61205 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pafah1b3Q61205 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pafah1b3Q61205 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pafah1b3Q61205 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pafah1b3Q61205 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pafah1b3Q61205 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pafah1b3Q61205 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pafah1b3Q61205 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pafah1b3Q61205 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pafah1b3Q61205 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pafah1b3Q61205 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pafah1b3Q61205 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pafah1b3Q61205 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pafah1b3Q61205 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pafah1b3Q61205 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pafah1b3Q61205 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pafah1b3Q61205 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pafah1b3Q61205 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pafah1b3Q61205 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pafah1b3Q61205 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pafah1b3Q61205 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pafah1b3Q61205 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pafah1b3Q61205 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pafah1b3Q61205 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pafah1b3Q61205 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pafah1b3Q61205 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pafah1b3Q61205 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pafah1b3Q61205 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pafah1b3Q61205 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pafah1b3Q61205 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pafah1b3Q61205 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pafah1b3Q61205 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pafah1b3Q61205 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pafah1b3Q61205 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pafah1b3Q61205 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pafah1b3Q61205 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pafah1b3Q61205 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pafah1b3Q61205 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pafah1b3Q61205 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pafah1b3Q61205 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pafah1b3Q61205 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pafah1b3Q61205 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pafah1b3Q61205 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pafah1b3Q61205 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pafah1b3Q61205 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pafah1b3Q61205 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms