Protein–RNA interactions for Protein: Q61165

Slc9a1, Sodium/hydrogen exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a1Q61165 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc9a1Q61165 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc9a1Q61165 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc9a1Q61165 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc9a1Q61165 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc9a1Q61165 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc9a1Q61165 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc9a1Q61165 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc9a1Q61165 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc9a1Q61165 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc9a1Q61165 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc9a1Q61165 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc9a1Q61165 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc9a1Q61165 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc9a1Q61165 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc9a1Q61165 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc9a1Q61165 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc9a1Q61165 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc9a1Q61165 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc9a1Q61165 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc9a1Q61165 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc9a1Q61165 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc9a1Q61165 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc9a1Q61165 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc9a1Q61165 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc9a1Q61165 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc9a1Q61165 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc9a1Q61165 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc9a1Q61165 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc9a1Q61165 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc9a1Q61165 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc9a1Q61165 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc9a1Q61165 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc9a1Q61165 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc9a1Q61165 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc9a1Q61165 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc9a1Q61165 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc9a1Q61165 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc9a1Q61165 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc9a1Q61165 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc9a1Q61165 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc9a1Q61165 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc9a1Q61165 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc9a1Q61165 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc9a1Q61165 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc9a1Q61165 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc9a1Q61165 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc9a1Q61165 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc9a1Q61165 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc9a1Q61165 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc9a1Q61165 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc9a1Q61165 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc9a1Q61165 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc9a1Q61165 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc9a1Q61165 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc9a1Q61165 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc9a1Q61165 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc9a1Q61165 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc9a1Q61165 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc9a1Q61165 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc9a1Q61165 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc9a1Q61165 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc9a1Q61165 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc9a1Q61165 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc9a1Q61165 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc9a1Q61165 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc9a1Q61165 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc9a1Q61165 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc9a1Q61165 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc9a1Q61165 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc9a1Q61165 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc9a1Q61165 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc9a1Q61165 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc9a1Q61165 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc9a1Q61165 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc9a1Q61165 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc9a1Q61165 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc9a1Q61165 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc9a1Q61165 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc9a1Q61165 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc9a1Q61165 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc9a1Q61165 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc9a1Q61165 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc9a1Q61165 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc9a1Q61165 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc9a1Q61165 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc9a1Q61165 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc9a1Q61165 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc9a1Q61165 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc9a1Q61165 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc9a1Q61165 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slc9a1Q61165 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slc9a1Q61165 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc9a1Q61165 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc9a1Q61165 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc9a1Q61165 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc9a1Q61165 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc9a1Q61165 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc9a1Q61165 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc9a1Q61165 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.4 ms